Die sleutelverskil tussen dNTP en ddNTP is dat dNTP of deoksiribonukleotiede die boustene van DNA is en 'n 3ʹ-OH-groep op die pentosesuikerstruktuur het, terwyl ddNTP of dideoksinukleosiedtrifosfate nukleotiede is wat nie 3ʹ-OH-groepe het nie. word in Sanger dideoxy DNA-volgordebepalingstegniek gebruik om verskillende lengte DNA-volgordes te produseer.
dNTP en ddNTP is nukleotiede. dNTP verwys na deoksiribose nukleotiede. Hulle is die boustene van DNA. dNTP's word gebruik om DNA te sintetiseer. dNTP, aan die ander kant, verwys na dideoksinukleosiedtrifosfate. Hulle word in Sanger-volgordebepaling gebruik om DNA-sintese op verskillende lengtes te beëindig. Hulle het nie OH-groep op 3ʹ posisie nie. 'n Waterstof is teenwoordig by die posisie 3ʹ in plaas van OH-groep. Daarom is ddNTP's nie in staat om 'n fosfodiesterbinding met die volgende nukleotied te vorm nie. dNTP is in staat om die sintese van DNA uit te voer, terwyl ddNTP in staat is om die polimerisasie van DNA te beëindig.
Wat is dNTP?
dNTP staan vir deoksiribose-nukleotied of deoksiribonukleotied. Dit is die bousteen van DNA. Daar is vier tipes dNTP's. Hulle is dATP, dTTP, dCTP en dGTP. Hulle word benoem volgens die purien- of pirimidien-stikstofbasisse: Adenien (A), Guanien (G), Timien (T) en Sitosien (C)..
Figuur 01: dNTP
Adenien en guanien is purienbasisse terwyl timien en sitosien pirimidienbasisse is. Die pentosesuiker van dNTP is deoksiribose. Daar is ook 'n fosfaatgroep. Daarom bestaan dNTP uit drie komponente: 'n stikstofbasis, deoksiribosesuiker en 'n fosfaatgroep. Hierdie dNTP's kombineer met mekaar via fosfodiesterbindings. In dNTP's is daar 'n OH-groep geheg aan posisie 3ʹ van pentosesuiker wat nodig is om 'n skakel te vorm met die fosfaatgroep wat aan die 5ʹ koolstof van die suiker van die volgende nukleotied geheg is. Aangesien alle dNTP's hierdie 3ʹ -OH-groep het, is hulle in staat om DNA-stringe te sintetiseer en uit te brei. Gevolglik tree dNTP op as die basiese herhalende eenheid van DNA en chemiese stof van gene. Die sintese van DNA verloop altyd van 5ʹ tot 3ʹ.
Wat is DdNTP?
Sanger-volgordebepaling is 'n eerstegenerasie-DNS-volgordebepalingsmetode wat in 1977 deur Frederick Sanger en sy kolleges ontwikkel is. Dit staan ook bekend as Kettingbeëindigingvolgordebepaling of Dideoksievolgordebepaling aangesien die basiese beginsel van hierdie metode die kettingterminering is met behulp van dideoksinukleosiedtrifosfate (ddNTP's). ddNTP's is nukleotiede wat in Sanger-volgordebepaling gebruik word. Sanger-volgordebepaling is gebaseer op die selektiewe inkorporering van ddNTP's en beëindiging van DNA-sintese tydens die in vitro DNA-replikasie. Die spesialiteit van die ddNTP's is dat hulle 'n gebrek aan 3ʹ-OH-groep op die pentosesuiker het om fosfodiesterbindingsvorming tussen die fosfaatgroep van 5ʹ in aangrensende nukleotied voort te sit. Dus, sodra 'n ddNTP aan die verlengde string geheg is, hou kettingverlenging op en eindig vanaf daardie punt. ddNTP's tree op as kettingverlengende inhibeerders van DNA-polimerase tydens die Sanger-volgordebepalingsmetode.
Figuur 02: ddNTP
Daar is vier ddNTP's: ddATP, ddCTP, ddGTP en ddTTP wat in Sanger-volgordebepaling gebruik word. Hierdie nukleotiede stop die DNA-replikasieproses wanneer hulle in die groeiende DNA-string geïnkorporeer word. As gevolg hiervan produseer Sanger-volgordebepaling verskillende lengtes van kort DNS. Kapillêre gelelektroforese word gebruik om hierdie kort DNS-stringe volgens hul groottes op 'n jel te organiseer. ddNTP's word radioaktief of fluoresserend gemerk met verskillende kleure vir die gemak om die DNA-volgorde te ontleed. Deur die jel te ontleed, kan die nukleotiedvolgorde van die onbekende DNS-string bepaal word.
Wat is die ooreenkomste tussen dNTP en DdNTP?
- Beide dNTP en ddNTP word in Sanger-volgordebepaling gebruik.
- Daar is vier tipes dNTP's en ddNTP's.
- Hulle bestaan uit drie komponente: 'n stikstofbasis, deoksiribose suiker en fosfaatgroepe.
Wat is die verskil tussen dNTP en DdNTP?
dNTP is een van die vier tipes deoksiribonukleotiede wat boustene van DNA is. ddNTP is een van die vier tipes dideoksiribonukleosiedtrifosfate wat in Sanger-volgordebepalingstegniek gebruik word. dNTP het 'n 3ʹ-OH-groep op die pentosesuiker terwyl ddNTP nie 'n 3ʹ-OH-groep op die pentosesuiker het nie. Dit is dus die belangrikste verskil tussen dNTP en ddNTP. Boonop voer dNTP's DNA-polimerisasie uit terwyl ddNTP's DNA-polimerisasie beëindig. Dit is dus nog 'n groot verskil tussen dNTP en ddNTP.
Die onderstaande infografika lys die verskille tussen dNTP en ddNTP in tabelvorm.
Opsomming – dNTP vs DdNTP
Normale dNTP's is boustene van DNA terwyl ddNTP's nukleotiede is wat in Sanger-volgordebepalingstegniek gebruik word. dNTP het 3ʹ-OH terwyl ddNTP nie 3ʹ-OH het nie. Dit is dus die belangrikste verskil tussen dNTP en ddNTP. Boonop kan dNTP 'n DNA-string sintetiseer terwyl ddNTP die DNA-polimerisasie kan beëindig. Daarom word ddNTP's in Sanger-volgordebepaling gebruik om verskillende DNA-stringe met verskillende lengtes te produseer. Tydens die Sanger-volgordebepaling is beide dNTP en ddNTP ingesluit.
