Die sleutelverskil tussen sintenie en kollineariteit is dat sinteny die fisiese ko-lokalisering is van genetiese lokusse op dieselfde chromosoom in spesies, terwyl kollineariteit die fisiese mede-lokalisering is van genetiese lokusse op dieselfde chromosoom in verskillende spesies wat behou dieselfde bestelling.
Syntenie en kolineariteit is twee terme wat uitruilbaar in genomika gebruik word. Beide terme beskryf die geenlokaliseringspatrone op chromosome in verskillende spesies. Hierdie verwante geenrangskikkings onder die taksa is waardevolle inligting wanneer gedeelde afkoms van gene afgelei word. Synteny verwys na die fisiese ko-lokalisering van genetiese lokusse op dieselfde chromosoom in spesies. Kollineariteit verwys na die fisiese ko-lokalisering van genetiese lokusse op dieselfde chromosoom in verskillende spesies wat dieselfde orde bewaar. Daarom is dit 'n vorm van sinteny.
Wat is Synteny?
In verskillende spesies is daar 'n stel gene wat op dieselfde chromosoom geleë is. En hierdie fisiese mede-lokalisering van gene op dieselfde chromosoom in verskillende spesies staan bekend as sintenie. Hierdie gene word ook baie naby aan mekaar op 'n enkele chromosoom gevind. Die volgorde van die gene is dalk nie noodwendig dieselfde nie. Maar die lokalisering van gene naby mekaar op dieselfde chromosoom vind in sintensie plaas. Daarom beskryf sinteny hoofsaaklik die verspreidingspatroon van gene op 'n chromosoom. Hierdie patrone van geen-ko-lokalisering dui op verwantskappe tussen verskillende spesies en hul evolusie. Sintensie kan egter ontwrig word as gevolg van chromosomale herrangskikkings soos translokasies, inversie en chromosoomsamesmelting, ens. duplisering, verlies en ongelyke homoloë rekombinasie.
Figuur 01: Synteny
Daar word geglo dat alle gekoppelde gene sintenies is. Nie alle sinteniese gene is egter noodwendig gekoppel nie. Hulle beskik oor algemene chromosoomvolgordes. Mense het baie sinteniese gene met ander soogdiere. Boonop het baie graan sinteniese gene.
Wat is Collinearity?
Kolineariteit is 'n meer spesifieke vorm van sintenie waarin 'n stel gene op dieselfde chromosoom van verskillende spesies in dieselfde volgorde as in die voorvaderspesies geleë is. As daar dus 'n afwyking van kollineariteit is, sal dit 'n meer betroubare filogenetiese karakter wees aangesien kollineariteit die gedeelde afkoms van gene verklaar.
Figuur 02: Kollineariteit
Multiway collinearity analysis verskaf baie meer betroubare inligting oor die verwante spesies en hul filogenie.
Wat is die ooreenkomste tussen sinteny en collinearity?
- In beide sintenie en kollineariteit is 'n stel lokusse in twee verskillende spesies op dieselfde chromosoom geleë.
- Hierdie terme beskryf die fisiese ko-lokalisering van genetiese lokusse op dieselfde chromosoom.
- Kolineariteit is 'n meer spesifieke vorm van sintensie.
- Soms word albei terme uitruilbaar in genomika gebruik.
- As twee streke kolineariteit het, is hulle natuurlik sinteen.
- Hulle is nuttig om filogenie af te lei.
Wat is die verskil tussen sinteny en collinearity?
Syntenie en kolineariteit is twee terme wat uitruilbaar in genomika gebruik word. Synteny verwys na die fisiese ko-lokalisering van 'n stel gene in dieselfde chromosoom in verskillende spesies. Kollineariteit is 'n vorm van sintenie waarin die stel gene in dieselfde volgorde tussen die verskillende spesies saamgelokaliseer word. Daarom is dit die sleutelverskil tussen sinteny en collinearity.
Opsomming – Synteny vs Collinearity
Die terme sinteny en collinearity verwys na 'n stel gene wat op dieselfde chromosoom in verskillende spesies geleë is. Trouens, hierdie gene is mede-gelokaliseer in dieselfde chromosoom in verskillende spesies. Synteny beskryf die fisiese ko-lokalisering van setgene op dieselfde chromosoom in verskillende spesies, terwyl kollineariteit 'n meer spesifieke vorm van sintenie is waarin die stel gene in dieselfde volgorde geko-lokaliseer is. Dus, dit som die verskil tussen sinteny en collinearity op.
