Sleutelverskil – Bakteriële Transposases vs Retrovirale Integrases
Die vervoerbare genetiese materiaal het ontwikkel met twee hoofstrategieë om van een streek na die volgende streek van binne en tussen die genome te beweeg. Een metode is om deur 'n RNA-molekule te verplaas voor die vorming van 'n DNA-molekule, terwyl die ander pad DNA-tussenprodukte behels. Transposases en virale integrases is voorbeelde van sulke oordraagbare genetiese materiaal. Bakteriese transposases bind aan die einde van transposons en fasiliteer die katalise van die transposonbeweging na 'n ander deel van die genoom deur verskeie meganismes. Retrovirale integrase is ensieme wat help met die integrasie van die genetiese materiaal van retrovirus soos MIV in die genetiese materiaal (DNS) van die gasheersel wat dit besmet. Dit is die sleutelverskil tussen bakteriese transposases en retrovirale integrases.
Wat is bakteriese transposases?
Transposase kan gedefinieer word as 'n ensiem gebind aan die einde van transposons wat die katalise van die transposonbeweging na 'n ander deel van die genoom deur verskeie meganismes fasiliteer. Sulke meganismes sluit in 'sny-en-plakmeganisme' en 'replikatiewe transposisiemeganisme'. Transposase is eers ingebring deur die kloning van die ensiem wat nodig is vir die transposisie van die Tn3 transposon. Twee belangrike strategieë is deur die oordraagbare genetiese elemente gebruik vir die verplasing tussen genome of van een plek na 'n ander. Die vervoer deur 'n intermediêre van RNA voor die sintese van 'n DNA-kopie is een strategie terwyl die ander aan DNA-tussenprodukte alleen gebind word. Die rekombinasiereaksies wat betrokke is by die integrasie van beide elemente vind plaas as gevolg van element-spesifieke ensieme. Dus, in 'n geval van DNA-elemente, staan hierdie ensieme bekend as transposases, terwyl hulle in 'n geval van RNA-elemente as integrase bekend staan.
Wanneer die verskille tussen beide die transposisiestrategieë vergelyk word, blyk die proses van invoeging chemies identies te wees. Maar onlangse bewyse stel voor dat die sekere ooreenkomste in integrasiemeganisme gesien word in die streke van aminosuurvolgordes wat 'n aktiewe plek vorm; die DDE-motief. Vyf families van transposases word tans geklassifiseer, maar die aantal families moet nog toeneem met nuwe transposase-karakters. Die families sluit in DDE transposase, Tyrosien (Y) transposase, Serine (S) transposase, Rolling circle transposase, Omgekeerde transkriptases/endonukleases (RT/En) ens. Hierdie families gebruik unieke katalitiese meganismes vir die breek en herverbinding van DNA. Die DDE-transposase behels die sny- en plakmeganisme van die oorspronklike transposon en dra drie stelle gekonserveerde aminosure, naamlik; aspartaat (D), aspartaat (D) en glutamaat (E). Die tyrosine-transposases betrek ook die sny-en-plakmeganisme deur die benutting van tirosienresidu, wat plekspesifiek is.
Figuur 01: Bakteriële transposases
Die serine-transposases behels 'n intermediêre van sirkelvormige DNA en voer die sny-en-plak-meganisme uit net soos bogenoemde families. Die rollende sirkel transposase behels die inkopie-meganisme waar 'n enkele string direk na die teikenplek gekopieer word deur DNA-replikasie. Dit verseker dat die sjabloonstring en die gekopieerde string 'n string het wat nuut gesintetiseer is. Die omgekeerde transkripsie/endonuklease transposase het verskeie meganismes vir transposisie.
Wat is retrovirale integrase?
In die konteks van Retrovirale Integrase, word dit beskou as 'n retrovirale ensiem wat help met die integrasie van die genetiese materiaal van retrovirus soos MIV in die genetiese materiaal (DNS) van die sel wat geïnfekteer is. Hierdie retrovirale integrase word meestal verwar met faag-integrase. Voorbeelde van faag-integrase is λ-faag-integrase. Maar dit is heeltemal verskillende ensieme en moet nie verwar word met. Met betrekking tot die vorming van retrovirale pre-integrasie kompleks, speel retrovirale integrase 'n groot rol. Retrovirale integrase proteïene bestaan tipies uit drie (03) kanoniese domeine. Hierdie domeine word deur buigsame skakelaars verbind.
Die drie domeine sluit 'n N-terminaal sinkbindende domein in waar drie heliese bundels verbind en gestabiliseer word deur koördinasie met die betrokkenheid van 'n Zn2+ katioon, 'n RNase H-vou katalitiese kerndomein en 'n C-terminale DNA-bindingsdomein, wat 'n SH3-vou is. Deur ondersoek en deur biochemiese en strukturele inligting, dui dit daarop dat retrovirale integrase die vermoë het om as 'n dimeer van dimmers (tetrameer) te funksioneer. In die konteks van multimerisasie en virale DNA-binding, al drie domeine van die retrovirale integrase proteïen. Die hooffunksie van retrovirale integrase is om sy genetiese materiaal in gasheer-DNS in te voeg. Hierdie stap is die mees deurslaggewende stap in virale replikasie van MIV-virus. Sodra dit suksesvol geïntegreer is, sal dit vir die res van sy leeftyd daar in die chromosomale DNA van die sel wees.
Figuur 02: Retrovirale Integrases
Daarom, sodra dit geïntegreer is, is daar geen terugkeer vir die sel nie. Hierdie retrovirale integrase behels die katalisasie van twee hoofreaksies, insluitend 3'-eindverwerking en kovalente ligasie. Tydens 3'-kant-prosessering word 2-3 nukleotiede van beide 3'-punte van die virale DNA verwyder met die bedoeling om die CA-dinukleotiede van die 3'-punte van die virale DNA te openbaar, en tydens kovalente afbinding word die verwerkte 3'-punte van virale DNA word kovalent in die gasheer se chromosomale DNA gelig.
Wat is die ooreenkoms tussen bakteriese transposases en retrovirale integrases?
Beide Bakteriële Transposases en Retrovirale Integrases het soortgelyke aminosuurvolgordes
Wat is die verskil tussen bakteriese transposases en retrovirale integrase?
Bakteriese Transposases vs Retrovirale Integrases |
|
| Bakteriese Transposase is 'n ensiem wat aan die einde van transposons gebind word terwyl dit die katalise van die transposonbeweging na 'n ander deel van die genoom deur verskeie meganismes vergemaklik. | Retrovirale Integrases word beskou as 'n retrovirale ensiem wat help met die integrasie van die genetiese materiaal van retrovirus soos MIV in die genetiese materiaal (DNS) van die sel wat geïnfekteer is. |
| Binding streke | |
| Hoë spesifieke bindingstreke word benodig vir bakteriese transposases. | Minder of geen nukleotiedvolgorde benodig vir binding nie. |
Opsomming – Bakteriële Transposases vs Retrovirale Integrases
Bakteriese transposases word beskou as 'n retrovirale ensiem wat help met die integrasie van die genetiese materiaal van retrovirus soos MIV in die genetiese materiaal (DNS) van die sel wat geïnfekteer is. Twee belangrike strategieë is deur die oordraagbare genetiese elemente gebruik vir die verplasing tussen genome of van een plek na 'n ander. Vyf families van transposases word tans geklassifiseer, maar die aantal families moet nog toeneem met nuwe transposase-karakters. Retrovirale Integrase, dit word beskou as 'n retrovirale ensiem wat help met die integrasie van die genetiese materiaal van retrovirus soos MIV in die genetiese materiaal (DNS) van die sel wat besmet is. Retrovirale integrase proteïene bestaan tipies uit drie (03) kanoniese domeine. Die hooffunksie van retrovirale integrase is om sy genetiese materiaal in gasheer-DNS in te voeg. Hierdie stap is die mees deurslaggewende stap in virale replikasie van MIV-virus. Dus, sodra dit geïntegreer is, is daar geen terugkeer vir die sel nie. Dit is die verskil tussen bakteriese transposases en retrovirale integrase.
Laai die PDF af van Bakteriële Transposases vs Retrovirale Integrases
Jy kan die PDF-weergawe van hierdie artikel aflaai en dit vir vanlyn doeleindes gebruik soos per aanhalingsnota. Laai asseblief die PDF-weergawe hier af: Verskil tussen bakteriese transposases en retrovirale integrase
