Sleutelverskil – Stroomop vs Stroomaf DNA
Dit is belangrik om 'n algemene kennis te hê oor die samestelling en struktuur van DNS om die verskil tussen stroomop en stroomaf DNS te verstaan. DNA is saamgestel uit polinukleotiedkettings. Nukleotiede is die boustene wat polinukleotiedkettings skep en elke nukleotied bestaan uit drie komponente: 'n vyfkoolstofsuiker, 'n stikstofbasis en 'n fosfaatgroep. 'n Fosfaatgroep en 'n OH-groep is onderskeidelik aan 5'-posisie-koolstof en 3'-posisie-koolstof van die suikermolekule in 'n nukleotied geheg. Nukleotiede word saamgevoeg deur fosfodiesterbindings wat gevorm word tussen 5'-fosfaatgroep van een nukleotied en 3' OH-groep van die aangrensende nukleotied. As 'n polinukleotiedketting 'n vrye 5'-fosfaatgroep het, word dit as die 5'-uiteinde toegeken; as dit 'n vrye 3' OH-groep het, word dit as 'n 3'-einde toegeken. Daarom het DNA-stringe gewoonlik 5'- en 3'-punte volgens die eindposisies van die polinukleotiedkettings. DNA bestaan ook as dubbelstrengs vorm. Twee stringe is antiparallel aan mekaar. Daarom het DNA twee stringe wat in die rigting van 5' tot 3' en 3' tot 5' rigting loop. Stroomop en stroomaf DNS word verwys met verwysing na transkripsie en sintese van 5' tot 3' mRNA-string. As DNA na die 5-kant van die koderende string vanaf die transkripsie-inisiasieplek beskou word, staan dit bekend as stroomop-DNS. As DNA na die 3'-kant van die koderende string vanaf die transkripsie-inisiasieplek beskou word, staan dit bekend as stroomaf DNA. Dit is die sleutelverskil tussen stroomop- en stroomaf-DNS.
Wat is stroomop-DNA?
'n Geen is 'n strukturele en funksionele eenheidsoorerwing wat op DNA van 'n organisme geleë is. Dit word gestoor met instruksies om 'n proteïen te konstrueer. Die geen het 'n spesifieke area van 'n DNA-molekule. Wanneer dit nodig is, transkribeer en vertaal dit in 'n proteïen via sintese van 'n mRNA-string. Normaalweg loop 'n koderende string van die geen van 5'- tot 3'-rigting. Wanneer dit getranskribeer word, produseer dit 'n mRNA-string in dieselfde rigting 5' tot 3'. Tydens die transkripsie word 3' tot 5' antisense string gedien as die sjabloon string en begin die mRNA sintese. Daar is 'n transkripsie-inisiasieplek in die geen. Met verwysing na die transkripsie-inisiasieplek, staan die DNS-gebied na die 5'-punt van die koderende string bekend as stroomop DNS. 'n Promotor van die geen is normaalweg in die stroomop-streek van DNA geleë. In eukariotiese gene is daar TATA-bokse, proksimale promotorelemente en versterkers in die area stroomop van die geen. Die stroomopstreek van die geen word met negatiewe getalle verwys. Stroomop DNA van 'n geen is van uiterste belang vir die transkripsie.
Wat is stroomaf-DNA?
Transkripsie-inisiasieplek staan bekend as +1 punt van 'n geen. Die DNS-streek vanaf +1 punt na die 3'-punt van die koderende string staan bekend as stroomaf DNS. Met ander woorde, stroomaf van die geen is vanaf die transkripsie-inisiasieplek na die 5'-kant van die sjabloonstring. Daarom sluit stroomaf DNA van 'n geenstreek transkripsionele eenheid en ander volgordes soos terminatorvolgorde in. Die promotor kan die stroomafvolgorde van 'n geen beïnvloed. Stroomaf deel van 'n geen word met positiewe getalle verwys. Stroomaf DNA van 'n geen is die werklike streek wat die proteïenproduk gee.
Figuur 01: Stroomop en Stroomaf DNA
Wat is die verskil tussen stroomop- en stroomaf-DNS?
Stroomop vs Stroomaf DNA |
|
| DNA-streek na die 5'-punt van die koderingsvolgorde vanaf die transkripsie-inisiasieplek staan bekend as stroomop-DNS. | DNA-streek na die 3'-punt van die koderende string vanaf transkripsie-inisiasieplek staan bekend as stroomaf DNA. |
| Elements | |
| Promotors en versterkers is geleë op die stroomop DNA | Transkripsie-eenheid en die terminatorreekse is in die stroomaf-DNS geleë. |
| Nommering | |
| Nukleotiede in die stroomop-streek word met negatiewe getalle verwys | Nukleotiede word met positiewe getalle verwys. |
| Funksie | |
| Hierdie streek bevat elemente wat nodig is om transkripsie te reguleer en te inisieer | Hierdie streek bevat instruksies om 'n proteïen te produseer en die transkripsie te beëindig |
Opsomming – Stroomop vs Stroomaf DNA
Dit is maklik om stroomop en stroomaf van 'n RNA-string te identifiseer. Wat die verwysingsplek betref, staan die gebied na die 5'-kant van die RNA-string as stroomop-RNA bekend, terwyl die streek na die 3'-kant as stroomaf-RNA bekend staan. In DNA is daar egter twee stringe wat in beide rigtings 5' tot 3' en 3' tot 5' loop. Die verskil tussen stroomop en stroomaf DNA is dus ingewikkeld. Daarom word dit gedifferensieer met verwysing na die transkripsie van 'n geen. Vanaf die transkripsie-inisiasieplek na die 5-kant van die sinstring, staan DNA-streek bekend as stroomop-DNA, terwyl vanaf die transkripsie-inisiasieplek na die 3'-einde van die sintuigstring as stroomaf-DNA bekend staan. Dit is die verskil tussen stroomop en stroomaf van DNA.
