Die sleutelverskil tussen LYNE en SINEs is dat LYNE (lang interspersed nuclear elements) 'n tipe langer nie-LTR retrotransposons is terwyl SINEs (kort interspersed nuclear elements) 'n tipe baie korter nie-LTR retrotransposons is.
Nie-LTR retrotransposons bevat nie lang terminale herhalings (LTR) nie. Hulle bevat egter gene vir omgekeerde transkriptase, RNA-bindende proteïen, nuklease en ribonuklease H-domein. Nie-LTR retrotransposons het kort herhalings. Hierdie herhalings het 'n omgekeerde volgorde van basisse langs mekaar. Afgesien daarvan het nie-LTR-retrotransposons ook direkte herhalings wat in LRT-transposons gevind word. Nie-LTR retrotransposons val in twee kategorieë as LYNE en SINE's.
Wat is LYNE?
LYNE (lang afgewisselde kernelemente) is langer nie-LTR retrotransposons. Hulle is wydverspreid in die genome van eukariote. Hulle maak gewoonlik 21,1% van die menslike genoom uit. Elke LYN is ongeveer 7000 basispare lank. LYNE kan in mRNA transkribeer en vertaal in 'n proteïen wat as 'n omgekeerde transkriptase-ensiem kan funksioneer. Hierdie omgekeerde transkripsie produseer DNA-kopieë van die LINEs-RNA. Hierdie DNS-kopieë kan by 'n nuwe plek in die genoom geïntegreer word.
Figuur 01: LYNE en SINES
Die menslike genoom het net een volop LYN genaamd LYN-1. LINE-1 element is ongeveer 6000 basispare lank. Daar is ongeveer 100 000 afgeknotte LINE-1-elemente in die menslike genoom. Ewekansige mutasie kan in LYNE voorkom. As gevolg van ewekansige mutasies kan die LYNE degenereer. Hulle word nie meer getranskribeer of vertaal nie. Verder word LYNE in vyf hoofgroepe gegroepeer soos L1, RTE, R2, I en jokkie. Hierdie vyf groepe onderverdeel verder in nog 28 klades.
LYNE word normaalweg gepropageer deur middel van 'n meganisme genaamd teiken gevorderde omgekeerde transkripsiemeganisme (TPRT). Invoeging van LINE's veroorsaak menslike siektes soos hemofilie A, kanker, mendeliese afwykings, ens. Hipometilering van LINE's veroorsaak ook sekere tipes kanker.
Wat is SINE's?
SINEs (kort-afwisselende kernelemente) is 'n tipe baie korter nie-LTR retrotransposons. Hulle is ongeveer 100 tot 700 basispare lank. SINEs is ook DNA-elemente wat hulself deur eukariotiese genome deur RNA-tussenprodukte versterk. SINEs maak ongeveer 13% van die soogdiergenoom uit. Die interne streke van SINEs kom van tRNA af. Dit bly hoogs behoue. Hulle is dikwels teenwoordig in baie spesies gewerwelde en ongewerwelde diere. Die kopiegetalvariasie en mutasies in die SINEs kan geïnkorporeer word om die filogenie-gebaseerde klassifikasie van spesies te konstrueer.
SINEs kan in drie hooftipes gegroepeer word: CORE-SINEs, V-SINEs en AmnSINEs. Alu-element is die mees algemene SINE in primate. Boonop is daar meer as 50 menslike siektes wat verband hou met die invoeging van SINEs. Wanneer hulle binne of naby eksons invoeg, kan hulle onbehoorlike splitsing veroorsaak of die leesraam verander. Dit lei tot siekte-fenotipes soos borskanker, kolonkanker, leukemie, hemofilie, sistiese fibrose, kolonkanker, Dent se siekte, neurofibromatose, ens.
Wat is die ooreenkomste tussen LYNE en SINES?
- LINEs en SINEs is twee tipes nie-LTR retrotransposons.
- Albei het nie lang terminale streke (LTR) nie.
- Albei word oorwegend net in eukariote aangetref.
- Hulle is albei nie-outonoom.
Wat is die verskil tussen LYNE en SINE's?
LYNE is langer nie-LTR retrotransposons, terwyl SINEs baie korter nie-LTR retrotransposons is. So, dit is die belangrikste verskil tussen LINE's en SINE's. Verder kodeer LINES vir omgekeerde transkriptase ensiem, terwyl SINE nie vir omgekeerde transkriptase ensiem kodeer nie. Dit is dus nog 'n verskil tussen LYNE en SINE's.
Nog verskille tussen LYNE en SINEs word hieronder in tabelvorm gelys vir vergelyking langs mekaar.
Opsomming – LYNE vs SINEs
Retrotransposons word hoofsaaklik in alle eukariote aangetref, maar afwesig in prokariote. Ongeveer 37% van die menslike genoom bevat retrotransposons. Retrotransposons is hoofsaaklik twee tipes: LTR en Nie-LTR retrotransposons. Nie-LTR retrotransposons bevat nie lang terminale herhalings (LTR), wat teenwoordig is in LTR retrotransposons nie. Nie-LTR retrotransposons word verder in twee kategorieë verdeel: LYNE en SINEs. LYNE is langer nie-LTR retrotransposons, terwyl SINEs baie korter nie-LTR retrotransposons is. Dit is dus die opsomming van die verskil tussen LYNE en SINE's.
