Die sleutelverskil tussen primer en promoter is dat primer 'n kommersieel gesintetiseerde kort DNS-volgorde is wat in PCR gebruik word vir amplifikasie van 'n teiken DNS-volgorde terwyl promoter 'n spesifieke DNS-volgorde is wat 'n veilige aanvanklike bindingsplek vir RNA verskaf. polimerase en transkripsiefaktore om transkripsie te inisieer.
Primer en promotor is twee tipes DNS-volgordes. Primer is 'n klein fragment van DNA wat nodig is vir polimerase kettingreaksie (PCR). Dit het kort nukleotiedvolgordes aanvullend tot die flankerende einde van die DNS-string. Daar is twee tipes primers, en hulle werk as beginpunte vir die sintese van nuwe DNA-stringe. Daarteenoor is 'n promotor 'n spesifieke DNS-volgorde wat stroomop van die transkripsie-inisiasieplek van 'n geen geleë is. Dit tree direk in wisselwerking met die transkripsiemeganismekomponente soos RNA-polimerase en transkripsiefaktore om DNA-transkripsie te beheer. Daarom bind RNA-polimerase en ander transkripsiefaktore aan die promotorvolgorde en inisieer transkripsie.
Wat is 'n Primer?
Primers is kort DNS-volgordes wat ontwerp is vir die amplifikasie van teiken DNS-volgordes. Struktureel besit hulle kort nukleotiedvolgordes wat komplementeer tot die flankerende punte van die DNS-dubbelstringe. Hulle is gewoonlik ongeveer 20 nukleotiede lank. Tydens die PCR kataliseer Taq-polimerase die byvoeging van nukleotiede in die voorafbestaande nukleotiedvolgorde. Daarom dien primers as beginpunte vir die sintese van nuwe stringe. Taq-polimerase werk slegs in 5' tot 3'-rigting. Gevolglik vind DNA-sintese ook in dieselfde 5'- tot 3'-rigting plaas. Aangesien DNA dubbelstrengs is, is twee tipes primers nodig in PCR. Hulle staan bekend as die voorwaartse primer en reverse primer, gebaseer op die rigting van die verlenging van die primer tydens die DNA-sintese.
Figuur 01: Primers
Voorwaartse primer uitgloei met antisense DNA-string en begin die sintese van +-string van die geen in 5' tot 3'-rigting. Dit het 'n kort nukleotiedvolgorde wat komplementêr is tot die 3' flankerende einde van die antisense string. Omgekeerde primer gloei met die sintuigstring en begin die sintese van 'n komplementêre string van die koderende string, wat is - 'n string van die geen in 5'tot 3'-rigting. Omgekeerde primer word dus komplementêr tot die 3'-einde van die koderingsstring ontwerp. Beide omgekeerde en voorwaartse primers is belangrik vir die produksie van miljoene tot biljoene kopieë van spesifieke streke van DNS wat geteiken of geïnteresseerd is.
Wat is 'n promotor?
Die promotor is 'n DNS-volgorde wat stroomop of aan die 5′-punt van die transkripsie-inisiasieplek van 'n geen geleë is. Dit verskaf 'n bindingsplek vir RNA-polimerase en sekere regulatoriese elemente om die transkripsie van die geen te inisieer. Dit is 'n regulatoriese volgorde wat nodig is om 'n geen aan of af te skakel. Daar is 'n spesifieke nukleotiedvolgorde in die promotor. Dit kan 100–1000 basispare hê. Promotor toon die rigting van transkripsie. Boonop dui dit die sintuigstring aan wat getranskribeer moet word.
Figuur 02: Promotor van 'n geen
Daar is drie tipes promotorelemente as kernpromotor, proksimale promotor en distale promotor. Die kernpromotor is die minimale gedeelte van die promotor wat nodig is om transkripsie te begin. Dit is die mees proksimale aan die beginkodon geleë. TATA-boks is 'n bewaarde streek wat in baie eukariotiese kernpromotors voorkom. Dit word 25 tot 35 basispare stroomop van die transkripsiebeginplek gevind. Die proksimale promotor word meer stroomop na die kernpromotor gevind. Oor die algemeen is dit 250 basispare stroomop van die beginkodon geleë en bevat dit primêre regulatoriese elemente. Die distale promotor word stroomop van die proksimale promotor gevind, en dit bevat addisionele regulatoriese elemente. Bakteriële promotors het twee kortvolgorde-elemente in hul promotors. TATAAT is die konsensusvolgorde geleë by -10 van bakteriële promotor terwyl TTGACA die konsensusvolgorde by -35 is. Hulle staan bekend as -10 element en -35 element.
Wat is die ooreenkomste tussen Primer en Promoter?
- Primer en promotor is twee tipes DNS-volgordes.
- Hulle bestaan uit nukleotiedvolgordes.
- Beide primer en promotor is belangrik vir geenuitdrukking.
Wat is die verskil tussen Primer en Promoter?
Primer is 'n kort nukleotiedvolgorde wat ontwerp is vir die amplifikasie van teiken-DNS. Daarteenoor is die promotor 'n spesifieke regulerende DNS-volgorde wat stroomop na die transkripsie-inisiasieplek van 'n geen gevind word. Dus, dit is die belangrikste verskil tussen primer en promoter. Primers is ongeveer 20 basispare lank terwyl promotor 100 -1000 basispare kan hê. Funksioneel word primers gedien as beginvolgordes vir die nuwe string sintese terwyl promotors geentranskripsie beheer deur bindingsplekke vir RNA-polimerase en ander transkripsiefaktore te verskaf.
Boonop word 'n promotor gedefinieer as die rigting van die transkripsie en dui die sinstring van 'n geen aan. Struktureel is primer 'n kort, enkelstring DNS-volgorde terwyl promotor 'n lang dubbelstring DNS-volgorde is.
Die inligtingsgrafika hieronder bevat meer vergelykings wat verband hou met die verskil tussen onderlaag en promotor.
Opsomming – Primer vs Promoter
Primers is kort nukleotiedvolgordes aanvullend tot die flankerende punte van die teiken-DNS-dubbelstring. Twee tipes primers word in PCR gebruik. Hulle dien as die beginreekse vir die sintese van nuwe stringe. Primers is kommersieel ontwerp, en hulle is temperatuur stabiele reekse. Aan die ander kant is die promotor 'n regulatoriese volgorde van 'n geen wat stroomop na die transkripsie-inisiasieplek geleë is. Promotors beheer die transkripsie van gene. Hulle verskaf bindingsplekke vir RNA-polimerase en transkripsiefaktore om transkripsie te inisieer. Dit is dus die opsomming van die verskil tussen primer en promoter.
