Die sleutelverskil tussen molekulêre koppeling en telling is dat dok 'n tegniek is wat gebruik word om die bindingsaffiniteit tussen twee molekules te bepaal, terwyl telling 'n proses is om 'n spesifieke houding te evalueer deur die aantal gunstige intermolekulêre interaksies te tel.
Die terme molecular docking en scoring word gebruik in die veld van molekulêre modellering. Molekulêre modellering is 'n tegniek wat gebruik word om die moontlike rangskikkings van verskillende molekules in 'n gegewe stof te bepaal. Hierdie tegniek is belangrik om nuwe stabiele verbindings te skep.
Wat is molekulêre dok?
Molekulêre koppeling is 'n rekenaarsimulasie van 'n kandidaatligand wat aan 'n reseptor bind. Hierdie metode voorspel die voorkeuroriëntasie van een molekule na 'n ander molekule wanneer dit aan mekaar gebind word om 'n stabiele kompleks te vorm. Die resultate verkry uit hierdie tegniek kan gebruik word om die sterkte van assosiasie of bindingsaffiniteit tussen twee molekules te voorspel. Hier is die molekulêre tellingfunksie ook belangrik.
Figuur 01: 'n Eenvoudige diagram wat die proses van molekulêre interaksies in biologiese sisteme toon
Oor die algemeen beskou hierdie tegniek die biologies relevante molekules soos proteïene, peptiede, nukleïensure, koolhidrate en lipiede. Hierdie molekules is baie belangrik, en hulle speel 'n belangrike rol in seintransduksiemeganismes in ons liggaam. Daarom beïnvloed die oriëntasie van die twee molekules wat vir hierdie seintransduksieproses gaan bind, die tipe sein wat hier geproduseer word. Dit beteken; molekulêre koppeling is belangrik in die bepaling van beide die sterkte en die tipe sein wat tydens seintransduksie in biologiese stelsels geproduseer word.
Boonop is molekulêre koppeltegnieke belangrik in die ontwerp van struktuurgebaseerde medisyne. Dit is as gevolg van die voorspelbaarheid daarvan om konformasie van klein molekules soos ligande aan 'n geskikte bindingsplek te bind.
Wat is molekulêre telling?
Molekulêre telling is 'n tipe wiskundige funksie wat nuttig is om die vordering van molekulêre dok te evalueer. In die veld van rekenaarchemie word tellingfunksies gebruik om die bindingsaffiniteit tussen twee molekules te voorspel na die proses van dok. Byvoorbeeld, as ons 'n klein molekule van 'n deeltjie-geneesmiddel het en daar is 'n biologiese teiken soos 'n proteïen, kan ons die affiniteit van die geneesmiddel na die bindingsplek evalueer. Boonop kan die molekulêre telling gebruik word om die intermolekulêre interaksies tussen twee proteïene of tussen 'n proteïen en DNA-molekules te voorspel.
Figuur 02: Puntetellingfunksie in kort
Die belangrikste toepassing van molekulêre telling is in die geneesmiddelontwerpprosesse – byvoorbeeld virtuele sifting, de novo-ontwerp, loodoptimalisering, ens.
Wat is die verskil tussen molekulêre koppeling en puntetelling?
Molekulêre koppeling en telling is belangrik in molekulêre modellering. Die sleutelverskil tussen molekulêre koppeling en telling is dat koppeling 'n tegniek is wat gebruik word om die bindingsaffiniteit tussen twee molekules te bepaal, terwyl telling 'n proses is om 'n spesifieke houding te evalueer deur die aantal gunstige intermolekulêre interaksies te tel.
Die volgende infografika som die verskil tussen molekulêre koppeling en telling op.
Opsomming – Molekulêre koppeling vs telling
Molekulêre koppeling en telling is belangrik in molekulêre modellering. Die sleutelverskil tussen molekulêre koppeling en telling is dat koppeling 'n tegniek is wat gebruik word om die bindingsaffiniteit tussen twee molekules te bepaal, terwyl telling 'n proses is om 'n spesifieke houding te evalueer deur die aantal gunstige intermolekulêre interaksies te tel.