Die sleutelverskil tussen kandidaatgeen en GWAS is dat kandidaatgeenbenadering die genetiese variasie binne 'n klein aantal voorafgespesifiseerde gene van belang ondersoek, terwyl GWAS die hele genoom ondersoek vir 'n algemene genetiese variasie agter 'n spesifieke siektetoestand.
Kandidaatgeenbenadering en genoomwye assosiasiestudies (GWAS) is twee metodes wat belangrik is om genetiese vatbaarheid vir siektes op te spoor. Kandidaat geenbenadering is gebaseer op 'n vooraf gespesifiseerde klein aantal gene terwyl GWAS gebaseer is op die toets van die hele genoom. Gevolglik vereis kandidaat-geenbenadering voorafkennis van gene met betrekking tot die siekte, anders as GWAS.
Wat is kandidaat-gene?
Kandidaatgeenbenadering is een van die tegnieke wat die verband tussen genetiese variasie binne voorafgespesifiseerde gene van belang en fenotipes of siektetoestande ondersoek. In hierdie benadering is dit nodig om vooraf kennis te hê van die geen se biologiese funksionele impak op die betrokke eienskap of siekte. Op grond van hierdie kennis word 'n klein aantal gene geselekteer en ontleed vir genetiese variasie.
Figuur 01: Kandidaat-genebenadering
Seleksie van die gene word gemaak op grond van die biologiese, fisiologiese en funksionele relevansie vir die betrokke siekte in hierdie benadering. Hierdie benadering word dikwels as 'n gevallekontrolestudie ontwerp.
Wat is GWAS?
GWAS staan vir Genome-Wide Association Study. Dit verwys ook na heel-genoom assosiasie studies. Hierdie studies fokus hoofsaaklik op waarnemingstudies. Hulle ontleed die genetiese variante van verskillende individue wat gewoonlik met 'n spesifieke eienskap geassosieer word. Die hele genoom is belangrik vir GWAS-analise.
GWAS is 'n belangrike hulpmiddel in die ontleding van enkelnukleotied-polimorfismes wat met verskeie siektetoestande geassosieer word. Dit is 'n vergelykende studie van die verskillende enkelnukleotied polimorfismes oor 'n wye populasie. Die studiesteekproef van GWAS is baie hoog; dus neem dit ook die formaat van 'n deursnee-kohortstudie aan.
Figuur 02: GWAS
Die eerste GWAS-studie het plaasgevind met betrekking tot miokardiale infarksie en die ontleding van die gene wat met miokardiale infarksie geassosieer word. Tans speel GWAS 'n belangrike rol in die bepaling van die genetiese agtergrond van komplekse siektes met onbekende etiologie.
Wat is die ooreenkomste tussen kandidaatgene en GWAS?
- Beide kandidaat-geenbenadering en GWAS is tegnieke wat die genetiese assosiasie tussen genotipe en fenotipe van die siekte ontleed.
- Albei benaderings help om die genetiese basis van vatbaarheid vir siektes te verstaan.
Wat is die verskil tussen kandidaat-geen en GWAS?
Kandidaatgeenbenadering is gebaseer op die kandidaatgene of voorafgespesifiseerde gene, terwyl GWAS op die hele genoom gebaseer is. Dit is dus die sleutelverskil tussen kandidaatgeen en GWAS. In kandidaatgeenbenadering is die seleksie van gene ook nodig terwyl dit nie in GWAS benodig word nie.
Boonop vereis kandidaat-geenbenadering voorafkennis oor die gene wat relevant is tot die siekte, terwyl dit nie nodig is vir GWAS nie.
Infografika hieronder verskaf 'n meer gedetailleerde vergelyking wat verband hou met die verskil tussen kandidaatgeen en GWAS.
Opsomming – Kandidaat Gene vs GWAS
Kandidaatgeen en GWAS is twee geenassosiasiestudies. Kandidaat geenbenadering fokus op die genetiese variasie wat met die siekte geassosieer word binne 'n klein aantal voorafgespesifiseerde gene. Daarteenoor ondersoek GWAS die genetiese variasie wat met die siekte geassosieer word binne die hele genoom. Dit is dus die sleutelverskil tussen kandidaatgeen en GWAS. Albei metodes is belangrik om die genetiese basis van vatbaarheid vir siektes te verstaan.
