Die sleutelverskil tussen QTL en GWAS berus op die tipe rye wat in die analise gebruik word. QTL gebruik koppelingsgeen lokusse om fenotipiese eienskappe wat met poligeniese oorerwing geassosieer word te ontleed, terwyl GWAS heelgenoomvolgordes gebruik om enkelnukleotiedpolimorfismes van 'n spesifieke toestand te analiseer.
QTL-kaarte en GWAS speel 'n belangrike rol in die genetiese ontledings vir verskillende eienskappe. Verder is hulle belangrik in die ontleding van verskeie siektetoestande met onbekende etiologie. Boonop speel volgordebepaling 'n sleutelrol in beide tegnieke. Hierdie tegnieke kan verder gekoppel word aan ander hoë deurset tegnieke vir verhoogde akkuraatheid en presisie.
Wat is QTL?
QTL staan vir Quantitative Trait Locus. Dit is 'n gebied van die DNA wat met 'n fenotipiese eienskap geassosieer word. Oor die algemeen gee 'n QTL aanleiding tot poligeniese effekte. Die verspreiding van QTL's wissel, en die aantal QTL's dui op die mate van variasie van 'n bepaalde fenotipiese eienskap. Verder kodeer hulle tipies vir onderliggende aaneenlopende eienskappe en nie diskrete eienskappe nie.
By die identifikasie van die QTL-streke, is dit belangrik om 'n spesifieke QTL-area te volgorde. Verder, om ondersoeke en navorsing maklik te maak, vind volgordebepaling en berging van die volgordedata van die algemene QTL-streke plaas met die betrokkenheid van bioinformatika. Ons noem hierdie tegniek QTL-kartering. Vervolgens bou 'n databasis op met die QTL-streekreekse.
Figuur 01: QTL-skandering
Verder maak die toepassings van QTL-reekse hoofsaaklik staat op BLAST-instrument, waar die volgorde-ooreenkoms bepaal kan word. Dit is belangrik om verwantskappe tussen organismes af te lei. Verder is dit belangrik om die kompleksiteit van 'n bepaalde poligeniese fenotipe te bepaal. Dit bepaal ook die evolusie van 'n spesifieke eienskap.
Op die oomblik word QTL-analise gekombineer met ander hoë deursettegnieke soos DNA-mikroskikkings. Dit is belangrik in die uitdrukkingsanalise van die fenotipe. Tans stel wetenskaplikes baie belang in die ontwikkeling van die QTL-databasis aangesien QTL-streke verantwoordelik is vir baie belangrike eienskappe van verskillende spesies.
Wat is GWAS?
GWAS staan vir Genome Wide Association Study. Dit verwys ook na hele genoom assosiasie studies. Hierdie studies fokus hoofsaaklik op waarnemingstudies. Dit ontleed die genetiese variante van verskillende individue wat gewoonlik met 'n spesifieke eienskap geassosieer word. Boonop is die hele genoom belangrik vir GWAS-analise.
Figuur 02: GWAS
GWAS is 'n belangrike hulpmiddel in die ontleding van enkelnukleotied-polimorfismes wat met verskeie siektetoestande geassosieer word. Dit is ook 'n vergelykende studie van die verskillende enkelnukleotied polimorfismes oor 'n wye populasie. Daarbenewens is die studiesteekproef van GWAS baie hoog; dus neem dit ook die formaat van 'n deursnee-kohortstudie aan.
Verder het die eerste GWAS-studie plaasgevind met betrekking tot miokardiale infarksie en die ontleding van die gene wat met miokardiale infarksie geassosieer word. Tans speel GWAS 'n belangrike rol in die bepaling van die genetiese agtergrond van komplekse siektes met onbekende etiologie.
Wat is die ooreenkomste tussen QTL en GWAS?
- Hulle maak staat op DNS-volgordedata vir die ontleding.
- Albei word geassosieer met die genetiese agtergronde van verskeie karakters.
- Verder benodig hulle bioinformatika-instrumente om resultate af te lei en te interpreteer.
- Hulle word op groot bevolkings gedoen.
Wat is die verskil tussen QTL en GWAS?
QTL ontleed die fenotipiese eienskappe wat met poligeniese oorerwing geassosieer word deur gebruik te maak van gekoppelde geen-lokusse, terwyl GWAS enkelnukleotied-polimorfismes van 'n spesifieke toestand ontleed deur heelgenoomvolgordes te gebruik. Dit is dus die belangrikste verskil tussen QTL en GWAS. QTL-kartering is relatief 'n minder komplekse tegniek as GWAS aangesien dit heelgenoomvolgordebepaling vereis.
Die onderstaande infografika som die verskil tussen QTL en GWAS in tabelvorm op.
Opsomming – QTL vs GWAS
QTL-kartering en GWAS speel 'n groot rol in die bepaling van die genetiese agtergrond van verskeie fenotipiese eienskappe. Hulle help ook met die ontleding van die genetiese agtergrond van verskillende siektes. QTL-kartering karteer die koppelingsgene wat verantwoordelik is vir deurlopende eienskappe, en behels ook die kartering van die poligeniese oorerwingsgene. GWAS, aan die ander kant, vind plaas met heelgenoom ontleding vir enkelnukleotied polimorfismes. Boonop vind dit oor 'n groter bevolking plaas. Dit is dus die opsomming van die verskil tussen QTL en GWAS.
