Die sleutelverskil tussen heelgenoomvolgordebepaling en eksoomvolgordebepaling is dat die hele genoomvolgordebepaling die hele genoom van 'n organisme in volgorde plaas terwyl die eksoomvolgordebepaling slegs die eksoom- of die proteïenkoderende gene van 'n organisme volg.
Opeenvolging is 'n tegniek wat die presiese volgorde van die nukleotiede in 'n spesifieke DNS-molekule bepaal. Dit weerspieël bloot die korrekte volgorde van die vier basisse; adenien (A), guanien (G), sitosien (C) en timien (T) in 'n DNA-fragment. Daar is verskeie volgordebepalingsmetodes soos Sanger-volgordebepaling, volgendegenerasievolgordebepaling, ens. Verder kan óf die volledige genoom van 'n organisme (heelgenoomvolgordebepaling) óf slegs die proteïenkoderende gene in die genoom (eksoomvolgordebepaling) volgordebepaling ondergaan.
Wat is heelgenoomvolgorde?
Die menslike genoom bevat byna drie biljoen basispare DNA. Die hele genoomvolgordebepaling is 'n metode wat die volledige genoom van 'n organisme orden. In heelgenoomvolgordebepaling is die oorweging dus op die hele versameling DNS-molekules, insluitende eksome, introne, intergeniese ruimtes, ens. Boonop volg die hele genoomvolgordebepaling nie net die genoom wat binne die kern woon nie, maar ook die mitochondriale DNS..
Figuur 01: Heelgenoomvolgorde
In die voorbereiding vir hierdie volgordebepaling is die eerste stap om die hele DNA te onttrek. Dan ondergaan die onttrekte DNA die volgordebepalingsprosedure met behulp van 'n geskikte volgordebepalingsmetode. Deur die gevolglike volgordes te ontleed, 'n bioinformatika-instrument te gebruik, kan ons die seldsame siektes, kanker, aansteeklike siektes, ens.uitvind.
Wat is Exome-volgordebepaling?
Exome is 'n deel van die genoom wat ongeveer 1,5% van die genoom bevat, en dit is die versameling van eksons. Eksons is die volgordes wat na mRNA en dan na die finale proteïenproduk transkribeer. Eksoom-volgordebepaling volg dus die hele proteïenkoderende reekse in die genoom. Eksoomvolgordebepaling openbaar die genetiese afwykings aangesien die meeste van die genetiese afwykings ontstaan as gevolg van die mutasies van die proteïenkoderende gene. Daarom gebruik diagnostiese prosesse van genetiese afwykings gereeld eksoomvolgordebepaling as 'n metode om die siekte te diagnoseer. Ook, wanneer vergelyk word met die hele genoom-volgordebepaling-toepassing vir genetiese toetsing, neem die eksoom-volgordebepaling minder tyd om te gebruik en is dit goedkoper.
Figuur 02: Exome-volgorde
In eksoomvolgordebepaling is dit eerstens nodig om slegs die proteïenkoderende volgordes uit die totale DNA te selekteer. Let daarop dat die mense ongeveer 180 000 proteïenkoderende volgordes het. Dan word die eksoom gerangskik deur gebruik te maak van 'n hoë deurset-volgordemetode.
Wat is die ooreenkomste tussen heelgenoomvolgordebepaling en eksoomvolgordebepaling?
- Helegenoom-volgordebepaling en eksoomvolgordebepaling is twee toepassings van volgordebepaling.
- Albei metodes is nuttig om die korrekte volgorde van die nukleotiedvolgorde in beide metodes te bepaal.
- Bioinformatika help ook in beide tegnieke om data te ontleed.
Wat is die verskil tussen heelgenoomvolgordebepaling en eksoomvolgordebepaling?
Helegenoom-volgordebepaling volgordes die hele DNA van die genoom van 'n organisme, terwyl die eksoom-volgordebepaling slegs die proteïenkoderende volgordes van die genoom af. Daarom is dit die fundamentele verskil tussen heelgenoomvolgordebepaling en eksoomvolgordebepaling. Alhoewel beide metodes wyd gebruik word om die korrekte volgorde van die nukleotiedvolgorde te bepaal, is die hele genoomvolgordebepaling duur en tydrowend as die eksoomvolgordebepaling.
Die onderstaande infografika tabelle die verskil tussen heelgenoomvolgordebepaling en eksoomvolgordebepaling.
Opsomming – Heelgenoom-volgordebepaling vs Eksoom-volgordebepaling
Opeenvolging openbaar die presiese volgorde van die basisse in 'n DNS-fragment en dit kan óf heelgenoomvolgordebepaling óf eksoomvolgordebepaling wees. Hier volg die hele genoom-volgordebepaling die volledige genoom van 'n organisme, terwyl die eksoom-volgorde slegs die proteïenkoderende volgordes in die genoom volg. Met inagneming van hul toepassings, is die hele genoomvolgordebepaling nuttig in die ontleding van die genetiese afwykings soos enkelnukleotiedvariasies, delesies, invoegings, ens. in die hele genoom terwyl die eksoomvolgordebepaling nuttig is om die genetiese siektes op te spoor. Daarom is dit die verskil tussen heelgenoomvolgordebepaling en eksoomvolgordebepaling.
