Die sleutelverskil tussen geteikende en nie-geteikende proteomika is dat die geteikende proteomika daarop gemik is om die oorvloed van 'n spesifieke proteïen te meet terwyl ongeteikende proteomika nie 'n spesifieke proteïen teiken nie.
Proteomics is die grootskaalse studie van proteïene, hul strukture en funksies. Dit bestudeer die hele proteïenkomplement in 'n sel, weefsel of 'n organisme onder spesifieke toestande. Daar is twee tipes proteomika as geteikende proteomika en ongeteikende proteomika.
Wat is geteikende proteomika?
Soos die naam aandui, teiken geteikende proteomika 'n spesifieke proteïen of 'n peptied in 'n komplekse mengsel van proteïene vir ontleding. Dan ontleed dit die teenwoordigheid en hoeveelheid van daardie voorafgeselekteerde spesifieke proteïen. Hierdie metode is moontlik vir slegs een monster of oor verskeie monsters. Hierdie metode is selfs geskik vir 'n spesifieke groep proteïene. Dit lei tot meer presiese, kwantitatiewe en sensitiewe data. Boonop lewer massaspektrometrie tesame met geteikende proteomika meer akkurate betroubare metings. Hierdie metode gebruik drievoudige kwadrupool massaspektrometer (QQQ) vir sy ontleding.
Figuur 01: Proteomics
Teikende proteomika is 'n geskikte metode as jy wil verifieer of 'n afslaanteiken werklik platgeslaan is of wanneer jy 'n spesifieke proteïen/peptied in bloedserum, serebrale vloeistof of in sellisaat, ens. wil kwantifiseer. Jy kan ook gebruik dit as jy wil kyk of 'n spesifieke proteïen differensieel uitgedruk word oor monsters of tydens 'n tydverloopeksperiment.
Wat is Untargeted Proteomics?
Ongeteikende proteomika, soos die naam noem, teiken nie 'n spesifieke proteïen of peptied vir die ontleding daarvan nie. Discovery proteomics is 'n ander naam vir Untargeted proteomics. Trouens, dit is 'n meer 'globale' analise. Oor die algemeen is die uitvoering van ongeteikende proteomika om die vraag te beantwoord "watter proteïene of proteïene is in hierdie monster of veelvuldige monsters?". Hierdie metode is nie sensitief as geteikende proteomika nie. Maar dit kan baie proteïene identifiseer en meet, insluitend nuwe proteïene. Ongerigte proteomika kan beide kwantitatiewe en kwalitatiewe metings produseer.
Wat is die ooreenkomste tussen geteikende en nie-geteikende proteomika?
- Beide geteikende en nie-geteikende proteomika meet proteïene in monsters.
- Hulle is belangrik in proteoomanalise.
- Hierdie metodes gebruik massaspektrometrie.
Wat is die verskil tussen geteikende en nie-geteikende proteomika?
Eerstens is geteikende proteomika die bepaling van die teenwoordigheid en hoeveelheid van 'n spesifieke proteïen of peptied in komplekse mengsel van proteïene. Daarteenoor is ongeteikende proteomika die kwantitatiewe en kwalitatiewe studie van proteïene wat in 'n monster of monsters teenwoordig is sonder om 'n spesifieke proteïen te teiken. Geteikende proteomika word uitgevoer met voorafgeselekteerde of geteikende proteïene terwyl ongeteikende proteomika uitgevoer word om die tipe proteïene in hierdie monster uit te vind. Boonop is geteikende proteomika meer sensitief as nie-geteikende proteomika.
Opsomming – Geteikende vs Untargeted Proteomics
Om op te som, geteikende en ongeteikende proteomika is twee tipes proteïenstudies. Soos hul name aandui, teiken geteikende proteomika 'n spesifieke proteïen terwyl ongeteikende proteomika nie 'n spesifieke proteïen teiken nie. Dit is die verskil tussen geteikende en nie-geteikende proteomika.
