Die sleutelverskil tussen Shine Dalgarno- en Kozak-volgorde is dat Shine Dalgarno-volgorde 'n ribosomale bindingsplek in bakteriële en argaeale boodskapper-RNA is, terwyl Kozak-volgorde 'n proteïentranslasie-inisiasieplek in die meeste eukariotiese boodskapper-RNA's is.
Shine Dalgarno- en Kozak-volgorde is twee konsensusreekse wat baie belangrik is vir die aanvang van vertaling. In molekulêre biologie is translasie die proses waardeur ribosome in die sitoplasma proteïene sintetiseer na die proses van transkripsie. In vertaling word 'n mRNA (boodskapper-RNA) in 'n ribosoom gedekodeer om 'n spesifieke aminosuurketting buite die kern te produseer. Tipies induseer 'n ribosoom die dekoderingsproses deur die binding van komplementêre tRNA-antikodonvolgordes aan mRNA-kodons te fasiliteer. Vertaling verloop in drie fases: inisiëring, verlenging en beëindiging.
Wat is Shine Dalgarno Sequence?
Shine Dalgarno-volgorde is 'n ribosomale bindingsplek in bakteriese en argaeale boodskapper-RNA. Dit is oor die algemeen geleë rondom 8 basisse stroomop van die beginkodon AUG. Hierdie RNA-volgorde help om ribosome na die boodskapper-RNA te werf deur die ribosoom in lyn te bring met 'n mRNA-beginkodon. Dit begin dus proteïensintese. Sodra na werwing, kan die tRNA aminosure byvoeg in volgorde soos gedikteer deur die mRNA-kodons. Hierdie spesiale volgorde is algemeen in bakterieë, maar skaarser in archaea. Boonop is dit ook teenwoordig in chloroplast- en mitochondriale transkripsies. Shine Dalgarno-volgorde is die eerste keer voorgestel deur Australiese wetenskaplikes John Shine en Lynn Dalgarno. Die ses basis konsensus volgorde is AGGAGG. Byvoorbeeld, in Escherichia coli is die volgorde AGGAGGU.
Figuur 01: Shine Dalgarno Sequence
Die keuse van inisiasieplek (AUG) hang af van die interaksie tussen die 30S-subeenheid van ribosoom en mRNA-sjabloon. Die pirimidienryke streek op die 16srRNA-komponent van 30S-subeenheid bind aan die purienryke streek bekend as Shine Dalgarno-volgorde stroomop van die AUG-inisiasiekodon in mRNA. Verder, tydens die vorming van die inisiasiekompleks, paar hierdie komplementêre nukleotiedvolgordes om 'n dubbelstring-RNA-struktuur te vorm. Dit vergemaklik die binding van mRNA aan 'n ribosoom op so 'n manier dat die inisiasiekodon by die P-plek van ribosoom geplaas word.
Wat is Kozak-reeks?
Kozak-volgorde is 'n proteïenvertalingsinisiasieplek in die meeste eukariotiese mRNA. Hierdie volgorde word ook die Kozak-konsensusvolgorde genoem. Kozak-volgorde is die optimum volgorde om translasie in eukariote te begin. Hierdie volgorde is 'n integrale aspek van proteïenregulering. Dit is ook baie belangrik vir algehele sellulêre gesondheid. Dit help om proteïenvertaling vanaf genetiese boodskappe reg te stel deur ribosoomsamestelling en translasie-inisiasie te bemiddel.
Figuur 02: Kozak-reeks
Hierdie volgorde is vernoem na die wetenskaplike wat dit ontdek het, Marilyn Kozak. Sy het dit ontdek deur 'n gedetailleerde ontleding van DNA-genomiese volgordes. Die Kozak-volgorde is 5' (gcc) gccRccAUGG-3'. Die hoofletters dui behoue basisse aan, terwyl kleinletters algemene veranderlike basisse aandui. R dui op 'n purien (adenien of guanien) wat altyd in hierdie plek geposisioneer is.
Wat is die ooreenkomste tussen Shine Dalgarno en Kozak Sequence?
- Shine Dalgarno- en Kozak-volgorde is twee konsensusreekse wat baie belangrik is in die begin van vertaling.
- Albei is RNA-volgordes.
- Die kleiner subeenheid van die ribosoom bind aan beide rye.
- Albei rye bemiddel die korrekte ribosoomsamestelling en translasie-inisiasie.
- Hulle is integrale aspekte van proteïenregulering en algehele sellulêre gesondheid.
Wat is die verskil tussen Shine Dalgarno en Kozak Sequence?
Shine Dalgarno-volgorde is 'n ribosomale bindingsplek wat in bakteriese en argaeale boodskapper-RNA voorkom, terwyl Kozak-volgorde 'n proteïentranslasie-inisiasieplek is wat in die meeste eukariotiese boodskapper-RNA voorkom. Dit is dus die belangrikste verskil tussen Shine Dalgarno en Kozak-volgorde. Verder is Shine Dalgarno-volgorde 5'AGGAGGU3' terwyl Kozak-volgorde 5' (gcc) gccRccAUGG-3' is.
Die volgende infografika lys die verskille tussen Shine Dalgarno- en Kozak-volgorde in tabelvorm vir vergelyking langs mekaar.
Opsomming – Shine Dalgarno vs Kozak Sequence
Shine Dalgarno- en Kozak-volgordes is twee konsensus-RNA-volgordes wat baie belangrik is vir ribosoomsamestelling en translasie-inisiasie. Shine Dalgarno-volgorde is 'n ribosomale bindingsplek in bakteriese en argaeale boodskapper-RNA, terwyl Kozak-volgorde 'n proteïentranslasie-inisiasieplek in die meeste eukariotiese boodskapper-RNA is. Dus, dit som die verskil tussen Shine Dalgarno en Kozak volgorde op.
