Die sleutelverskil tussen ITS1 en ITS2 is dat ITS1 'n spasieer-DNA is wat tussen 18S en 5.8S rRNA-gene in eukariote geleë is, terwyl ITS2 'n spasieerder-DNA is wat tussen 5.8S en 28S rRNA-gene in eukariote geleë is.
Interne getranskribeerde spasieerder (ITS) is die spasieerder-DNA gewoonlik geleë tussen klein subeenheid ribosomale RNA en groot subeenheid ribosomale RNA gene in die chromosoom of in die ooreenstemmende getranskribeerde gebied in die polisistroniese rRNA voorloper transkripsiemolekule. In bakterieë en archaea is daar slegs 'n enkele ITS tussen 16S en 23S rRNA gene. Maar in eukariote is daar twee ITS spacer DNA: ITS1 (tussen 18S en 5.8S rRNA gene) en ITS2 (tussen 5.8S en 28S rRNA). Daarom is ITS1 en ITS2 twee spasieer-DNA wat tussen rRNA-gene in eukariote gevind word.
Wat is ITS1?
ITS1 is 'n spasieer-DNS wat tussen 18S en 5.8S rRNA-gene in eukariote geleë is. ITS verwys na 'n stuk nie-funksionele spasieerder-DNA wat tussen rRNA-gene geleë is. ITS1 het 'n groter lengtevariasie as ITS2. Die lengtevariasie van ITS1 is ongeveer (200-300bp). ITS-merkers soos ITS1 het hul doeltreffendheid bewys om filogenetiese verwantskappe tussen verskillende taksa toe te lig. Boonop is ITS1-spasieer-DNA minder bewaar as ITS2-spasieer-DNA. ITS1-strukture word slegs in baie kleiner taksonomiese eenhede bewaar. Elke eukariotiese ribosomale groepering bevat ook streke wat eksterne getranskribeerde spasieers (5' en 3' ETS) genoem word.
Figuur 01: ITS1-streek
Die ITS1-spasieerder-DNA is baie naby aan die 5'eksterne getranskribeerde spasieerder (5'-ETS). Verder, as iemand die ITS1-gebied wil versterk vir filogenetiese verwantskapstudies, moet hulle 'n spesifieke primerpaar (reverse en forward primers) vir hierdie doel gebruik. Om ITS1-streek te versterk, word twee primer-stelle gewoonlik in die PCR-protokolle van laboratoriums gebruik. Hulle is ITS1 vorentoe en ITS2 agteruit of ITS1 vorentoe en ITS4 agteruit.
Wat is ITS2?
ITS2 is 'n spasieer-DNS wat tussen 5.8S en 28S rRNA-gene in eukariote geleë is. ITS2-streek het 'n korter lengtevariasie as die ITS1-streek. Die lengtevariasie van ITS2 is ongeveer (180-240bp). ITS2-streek is egter meer bewaar as ITS1-streek in baie taksonomiese eenhede. Dit identifiseer dat alle ITS2-reekse 'n gemeenskaplike kern van die sekondêre struktuur deel. Boonop word 40% ITS2-streek bewaar onder alle angiosperme, terwyl dit moontlik is om 50% van die ITS2-streek oor familie en hoër vlak te belyn.
Figuur 02: ITS2-streek
Ongeag die omvang van bewaring, gebruik van ITS2-streek ook baie gewild soos ITS1-streek in filogenetiese verwantskapstudies, veral in swam-DNA-strepieskodering. Om ITS2-streek te versterk, word 'n spesifieke primer-stel oor die algemeen in die PCR-protokolle van laboratoriums gebruik. Dit is ITS1 vorentoe en ITS4 omgekeerde. Maar wanneer PCR-protokol hierdie primerstel gebruik, versterk dit ook ITS1-streek saam met die ITS2-streek. Verder is die ITS2-spasieerder-DNA baie naby aan die 3'eksterne getranskribeerde spasieerder (3' ETS).
Oorgelykhede tussen ITS1 en ITS2
- ITS1 en ITS2 is twee spasieer-DNA geleë tussen rRNA-gene.
- Hulle kom slegs in eukariote voor.
- Albei kan versterk word deur spesifieke primer-pare te gebruik.
- Hulle word albei uitgesny in rRNA-rypwording as nie-funksionele neweprodukte.
- Albei is baie belangrik vir filogenetiese verwantskapstudies, veral in swam-DNA-strepieskodering.
Verskil tussen ITS1 en ITS2
ITS1 is 'n spasieer-DNS wat tussen 18S en 5.8S rRNA-gene in eukariote voorkom, terwyl ITS2 'n spasieer-DNS is wat tussen 5.8S en 28S rRNA-gene in eukariote geleë is. Dus, dit is die belangrikste verskil tussen ITS1 en ITS2. Verder het ITS1 groter lengtevariasie in vergelyking met ITS2. Aan die ander kant het ITS2 'n korter lengtevariasie in vergelyking met ITS1. Dit is nog 'n verskil tussen ITS1 en ITS2.
Die onderstaande infografika lys die verskille tussen ITS1 en ITS2 in tabelvorm vir vergelyking langs mekaar.
Opsomming – ITS1 vs ITS2
Interne getranskribeerde streek (ITS) is 'n nie-funksionele stuk spasieerder-DNA wat tussen rRNA-gene geleë is. In bakterieë en archaea is daar slegs 'n enkele ITS-streek. Maar in eukariote is daar twee ITS-streke: ITS1 en ITS2. ITS1 is 'n spasieer-DNA wat tussen 18S en 5.8S rRNA-gene in eukariote geleë is, terwyl ITS2 'n spasieer-DNS is wat tussen 5.8S en 28S rRNA-gene in eukariote geleë is. Dit is dus die opsomming van die verskil tussen ITS1 en ITS2.
