Die sleutelverskil tussen CDS en ORF is dat CDS daardie werklike nukleotiedvolgorde van 'n geen is wat in 'n proteïen vertaal, terwyl ORF 'n stuk DNA-volgorde is wat begin met translasie-inisiasieplek (beginkodon) en eindig met 'n vertalingbeëindigingswerf (stopkodon).
'n Geen het 'n koderende volgorde (CDS). Dit bestaan uit totale eksons van die geen en 'n beginkodon en 'n stopkodon. Dit is die werklike deel van die geen wat die proteïen vertaal en produseer. Oop leesraam of ORF is 'n nukleotiedvolgorde geleë tussen 'n beginkodon en 'n stopkodon. Daar is geen stopkodon binne 'n ORF wat die genetiese kode onderbreek wat in 'n proteïen vertaal nie. In prokariote is CDS en ORF van 'n geen dieselfde.
Wat is CDS?
CDS of koderingsvolgorde is die deel van die geen wat eintlik in 'n proteïen vertaal. Dit bestaan uit eksons en twee kodons bekend as AUG-kodon en stopkodon. CDS bevat nie twee onvertaalde streke nie: 5' UTR en 3' UTR. Boonop is introne nie by CDS's ingesluit nie.
Figuur 01: Kodervolgorde
Wanneer dit vergelyk word met die hele genoom van 'n individu, is koderende volgordes 'n klein fraksie. Kodervolgorde bestaan uit die nodige nukleotiedvolgorde om die aminosuurvolgorde van die proteïen te maak. Daarom is CDS gekonsentreerde eksons wat in nukleotieddrieling of kodons verdeel kan word. Kodons gee aanleiding tot aminosure.
Wat is 'n ORF?
Oop leesraam of ORF is die aaneenlopende stuk van 'n nukleotiedvolgorde wat begin met 'n beginkodon en eindig met 'n stopkodon. In eenvoudige woorde, ORF verwys na die gebied van die nukleotiedvolgorde geleë tussen begin- en stopkodons. Tussenin is daar geen stopkodon wat die ORF onderbreek nie. Die nukleotiedvolgorde tussen begin- en stopkodon kodeer vir aminosure. Oor die algemeen is beginkodon ATG, terwyl stopkodons TAG, TAA en TGA is. ORF gee 'n funksionele proteïen wanneer dit getranskribeer en vertaal word. ORF sluit dus 'n beginkodon, verskeie kodons in die middelstreek en 'n stopkodon in. Interessant genoeg het ORF 'n lengte wat deur drie gedeel kan word.
Figuur 02: Oop leesraam
In prokariote, aangesien daar geen introne is nie, is ORF die koderende volgorde van 'n geen wat direk in mRNA transkribeer. Daarom is CDS en PRF dieselfde in prokariote. Wanneer daar na gene in prokariote gesoek word, is dit maklik om 'n ORF op te spoor en 'n geen in prokariote te vind. In eukariote, aangesien daar introne is, is ORF die kodonvolgorde wat gevorm word na verwerking of RNA-splyting. ORF is 'n bewysstuk wat geenvoorspelling help solank ORF waarskynlik deel van 'n geen sal wees.
Wat is die ooreenkomste tussen CDS en ORF?
- In prokariote is CDS en ORF dieselfde.
- Albei het beginkodon en stopkodon.
- Hulle het 'n aantal nukleotiede wat deur drie gedeel kan word.
- Sodra hulle vertaal, produseer hulle aminosuurvolgordes.
Wat is die verskil tussen CDS en ORF?
CDS is die werklike deel van die geen wat in 'n proteïen vertaal, terwyl ORF die stuk DNA tussen 'n beginkodon en 'n stopkodon is. So, dit is die belangrikste verskil tussen CDS en ORF. Verder bevat CDS nie introne nie, maar ORF kan introne bevat. CDS transkribeer volledig in 'n volledige mRNA-volgorde terwyl ORF 'n deel van die mRNA-volgorde kan wees. Dit is dus nog 'n verskil tussen CDS en ORF.
Infografiese tabelle onderaan langs mekaar die verskille tussen CDS en ORF.
Opsomming – CDS vs ORF
CDS en ORF is twee belangrike dele van 'n geen. CDS verwys na die werklike DNA-gebied wat in 'n proteïen vertaal word. ORF is 'n volgorde van DNA wat begin met beginkodon "ATG" en eindig met enige van die drie terminasiekodons (TAA, TAG of TGA). ORF kan deel wees van die volledige mRNA van 'n geen. Die koderende volgorde van 'n geen transkribeer egter na volledige mRNA-volgorde. Alle CDS'e is ORF's. Maar nie alle ORF's is CDS'e nie. Dus, dit som die verskil tussen CDS en ORF op.
