Sleutelverskil – Proteomics vs Transcriptomics
Die omic-tegnologie is 'n huidige tendens, waar die verskillende biomolekules van 'n organisme as 'n hele versameling beskou word met betrekking tot sy eienskappe en funksies. Die omic-tegnologie het 'n wye verskeidenheid toepassings. Die verskillende omika van 'n biologiese monster sluit genomika, proteomika, transkriptomika en metabolomika in. Proteomika behels die volledige studie van alle proteïene in 'n lewende organisme. Dit word gedefinieer as die stel van alle uitgedrukte proteïene in 'n organisme, sy strukturele en funksionele eienskappe. Die volledige stel proteïene vorm dus die proteoom. Transcriptomics is die volledige studie van al die boodskapper RNA (mRNA) molekules wat in 'n lewende organisme teenwoordig is. Dus, transcriptomics handel oor die gene wat aktief uitgedruk word in 'n lewende organisme. Die totale stel mRNA in 'n lewende organisme word na verwys as die transkriptoom. Die belangrikste verskil tussen Proteomics en Transcriptomics is gebaseer op die tipe biomolekule. In proteomika word die totale stel uitgedrukte proteïene in 'n lewende organisme bestudeer terwyl, in transkriptomika, die totale mRNA van 'n lewende organisme bestudeer word.
Wat is Proteomics?
Die term proteomika is in die jaar 1995 geskep en is aanvanklik gedefinieer as die totale proteïenkomplement in 'n sel, weefsel of 'n organisme. Met die vooruitgang in proteomiese studies is dit toe gewysig om as 'n sambreelterm waarin baie studievelde ingesluit is, beskou te word. Tans, onder die onderwerp proteomika, word die struktuur, oriëntasie, funksies, sy interaksies, sy modifikasies, sy toepassings en die belangrikheid van proteïene bestudeer. Daarom word daar tans baie navorsing op die gebied van proteomika gedoen.
Die eerste proteomiese studies is gedoen om die proteïeninhoud in Escherichia coli te identifiseer. Die kartering van die totale proteïeninhoud is gedoen met behulp van tweedimensionele (2D) gels. Na die sukses hiervan het wetenskaplikes aanbeweeg om die totale proteïeninhoud in diere soos proefkonyne en muise te karakteriseer. Tans word menslike proteïenkartering gedoen met behulp van 2D-gelelektroforese.
Toepassings van Proteomics
Daar is baie voordele verbonde aan die bestudering van proteomika, aangesien proteïene die beheermolekules van die meeste van die aktiwiteit is as gevolg van die katalisator-eienskap van proteïene. Die studie van heel proteïene kan dus inligting verskaf rakende die gesondheidstatus van 'n organisme. Sommige toepassings is;
- Genoom-annotasie: Deur die proteïeninhoud van 'n organisme te bestudeer, kan die presiese genome wat vir die aktiewe proteïenverbinding verantwoordelik is, bepaal word. In hierdie scenario is resultate van alle genomika, Transcriptomics en proteomics belangrik.
- Siekte-identifikasie / Diagnostiek: Proteomika word gebruik in die identifikasie van die siektetoestand, deur die gesonde en die siekes te vergelyk
- Om proteïenuitdrukking uit te voer wat tydens eksperimentering bestudeer is.
- Proteïenmodifikasies en interaksiestudies: Om proteïene in vitro toestande of en in vivo toestande te gebruik, om die bergingstoestande van hierdie onttrekte proteïene te bepaal en om die gedrag van die proteïen in in vitro, in vivo en in te bestudeer – silico-metodes.
Figuur 01: Proteomics
Daar is verskillende tegnieke betrokke by proteomika
- Onttrekking van die totale proteïen en skeiding van die proteïene met behulp van 2D-gelelektroforese. Proteïene kan ook geskei word deur hoëprestasie-vloeistofchromatografie (HPLC) te gebruik.
- Opeenvolging van die onttrekte proteïene met behulp van metodes soos Edmund se volgordebepalingsmetode of massaspektrometrie.
- Sodra die rye geïdentifiseer is, word strukturele en funksionele eienskappe van die proteïeninhoud ontleed deur gebruik te maak van rekenaargebaseerde sagteware en bioinformatika-instrumente.
Wat is Transcriptomics?
Die transkripsieterm is onlangs geskep. Die Transcriptomics is die studie van die totale mRNA-inhoud van 'n organisme. Die totale mRNA is die uitgedrukte DNA in 'n lewende organisme of 'n sel. Daar word na die volledige versameling mRNA verwys as 'n transkriptoom.
Die stappe in die rigting van die ontleding van die transkripsie sluit in,
- Onttrekking van RNA, skeiding van mRNA met behulp van kolomgelchromatografie met poli-DT-krale.
- Die volgordebepaling van die mRNA word gedoen.
Microarray-tegnologie is een algemene manier om die transkripsie van 'n organisme te identifiseer. Die mikroskikkingstegniek behels 'n sondeplaat met die komplementêre stringe van die transkriptoom. By hibridisasie kan die mRNA wat in die organisme of selle teenwoordig is, gekarakteriseer word.
Figuur 02: Transkriptomiese tegnieke
Transcriptomics word nou algemeen in die mediese veld gebruik. Siektediagnostiek en siekteprofielvorming is hoofvelde waarin Transcriptomics gebruik word. Deur 'n transkripsie van 'n organisme te ontleed, kan vreemde mRNA geïdentifiseer word, en as daar enige infeksies is, kan dit geïdentifiseer word. Die nie-koderende RNA kan geskei word met behulp van transkriptomiese tegnologieë. En ook die uitdrukking van gene onder verskillende omgewingstres kan gemonitor word.
Wat is die ooreenkomste tussen Proteomics en Transcriptomics?
- Albei vorm deel van die konsep van omiese tegnologie.
- Albei word gebruik in siektediagnostiek en siektekarakterisering van 'n organisme.
- Albei studieareas het onttrekking van die biomolekule, skeiding van die biomolekule en volgordebepalingstappe behels.
Wat is die verskil tussen Proteomics en Transcriptomics?
Protemics vs Transcriptomics |
|
| Proteomics behels die volledige studie van alle proteïene in 'n lewende organisme. | Transcriptomics is die volledige studie van al die boodskapper-RNA (mRNA)-molekules wat in 'n lewende organisme teenwoordig is. |
| Bestudeerde biomolekuletipe | |
| Proteïene word in proteomika bestudeer. | mRNA word in transcriptomics bestudeer. |
| Faktore bestudeer | |
| Struktuur, funksie, interaksies, modifikasies en toepassings van die proteïene word in proteomika bestudeer. | Rekwensiestruktuur, interaksies met omgewing en toepassings van die mRNA word in transcriptomics bestudeer. |
Opsomming – Proteomics vs Transcriptomics
Omika speel 'n belangrike rol op die gebied van lewenswetenskappe. Proteomika verwys na die studie van die proteoom wat die volledige versameling proteïene in 'n sel of 'n organisme vorm. Transcriptomics verwys na die studie van die transkriptoom wat die volledige stel uitgedrukte DNA is wat in die vorm van mRNA is. Die twee studieareas, proteomika en transkriptomika, is afgelei na die bekendstelling van genomika en word tans wyd gebruik in mediese diagnostiek en in karakterisering en sifting van organismes. Dit is die verskil tussen proteomika en transkriptomika.
Laai die PDF van Proteomics vs Transcriptomics af
Jy kan die PDF-weergawe van hierdie artikel aflaai en dit vir vanlyn doeleindes gebruik soos per aanhalingsnota. Laai asseblief die PDF-weergawe hier af: Verskil tussen Proteomics en Transcriptomics
