Transposon vs Retrotransposon
Transposons en retrotransposons is genetiese komponente van DNA, en daar is groot verskille tussen hulle. Die persentasie teenwoordigheid van hierdie genetiese materiale verskil oor spesies, en hul funksies bepaal die lotgevalle van die organisme met mutasies en ander fenotipies belangrike veranderinge. Transposons en retrotransposons is gene of versamelings van sekere gene wat in die DNS-stringe geleë is, en veranderinge van hul liggings was die hoofoorsake vir hierdie gevolge. Hierdie artikel beoog egter om die funksies van hierdie gene kortliks te bespreek en bied 'n vergelyking tussen transposons en retrotransposons aan.
Wat is Transposon?
Transposons is interessante fragmente of segmente van DNS met die vermoë om die ligging van die DNS-string te verander in die vorm van sny-en-plak-meganisme. As gevolg van hierdie mobiele aard van die transposons, staan dit bekend as springgene. Transposons is van twee hooftipes bekend as Klas I Transposons en Klas II Transposons. Gewoonlik word na die Klas II-tipe verwys as die transposons en die Klas I-tipe word die retrotransposons genoem. Die prosesse van sny en plak van mobiele DNA-segmente word gereguleer deur die ensiem transposase. Die ensiem bind aan albei kante van die transposon en sny die fosfodiester-bindings van die DNA-string, isoleer die transposon, skuif dit na die teikenplek en bind op die nuwe plek. Hierdie proses is egter interessant om te verstaan, aangesien sommige transposons slegs na sekere liggings kan beweeg as gevolg van die onversoenbaarheid van basisreekse met die teikenplek. Gene met die een kant van 'n enkele string het dieselfde basisvolgorde met die ander kant van die ander enkelstring is transposons met taai rande, want dit kan aan die plekke van die teiken DNS-string bind met dieselfde basisvolgorde as in die taai punte. Hierdie mobiliteit van gene kan egter veranderinge van die genotipe sowel as in die fenotipe van die organisme veroorsaak. Wetenskaplikes wat oor die transposons uitgevind het en geneties gemodifiseerde voedsel en organismes volgens die voorkeuraanpassings is toe beskikbaar gestel. Hoogs produktiewe landbougewasse, antibiotika met medisinale eienskappe, veediere was van die voordelig ontwikkelde produkte na die uitvinding van transposons deur Barbara McClintock in die 1940's.
Wat is retrotransposon?
Retrotransposons is die Klas I-transposons, en dit beweeg deur die genoom deur die meganisme van kopieer en plak. Die meganisme van die mobiliteit van retrotransposons behels 'n paar belangrike stappe soos die kopiëring van die geensegment van die DNA-string na RNA, oordrag van die kopie van RNA na die teikenplek, transkripsie van die RNA-volgorde terug na DNA met behulp van omgekeerde transkripsie, en invoeging van die geen in die nuwe ligging van DNA-string van genoom. Die twee punte van hierdie retrotransposons het gewoonlik lang terminale herhalings met ongeveer 1000 basispare, en dit word as identifikasiekenmerke van hierdie gene gebruik. Hierdie gene word maklik binne die genoom geamplifiseer, en die persentasie van die retrotransposons in die menslike genoom is ongeveer 50%. Dit kan baie gevaarlik wees aangesien die veroorsakende virus van VIGS, MIV en T-sel leukemievirus die retrotransposons in hul RNA-genome het. Trouens, hierdie virusse kan die retrotransposons in enige plek van die menslike DNA-stringe bind met die gebruik van omgekeerde transkriptase en integrase. Die integrase-ensiem funksioneer op dieselfde manier as transposase in Klas II-transposons.
Wat is die verskil tussen Transposon en Retrotransposon?
• Transposons is Klas II-springgene terwyl retrotransposons in die kategorie van Klas I val.
• Transposons funksioneer met die transposase-ensiem terwyl retrotransposons funksioneer met die gebruik van twee hoofensieme bekend as omgekeerde transkriptase en integrase.
• Die eindpunte is baie langer in retrotransposons as in transposons.
• Transposons word van die oorsprong gesny en by die teiken geplak; omgekeerd word retrotransposons vanaf die oorsprong na RNA gekopieer en by die teiken getranskribeer.
• Die verskuiwing van retrotransposons behels RNA, maar nie in transposons nie.