Die sleutelverskil tussen plant- en dier-DNA-ekstraksie is dat dit in plant-DNS-ekstraksie nodig is om die selwand te breek deur die weefsel in droë ys of vloeibare stikstof te maal om sellulêre inhoud vry te stel terwyl dit in diere-DNS-ekstraksie is, is dit nie nodig om hierdie stap uit te voer nie aangesien diereselle nie 'n selwand het nie.
Genomiese DNA is die genetiese materiaal van plant- en dierselle. Genomiese DNA is uniek aan elke individuele plant of dier. Die DNS-onttrekking van DNS van goeie geh alte is die voorvereiste vir molekulêre navorsing. DNS van organismes word onttrek vir identifikasie, diagnose van siektes, opsporing van spesifieke gene en volgordes, forensiese doeleindes, vaderskaptoetsing, genoomvolgordebepaling, en ontwikkeling van dwelms, ens. DNS-ekstraksiemetode wissel na gelang van die tipe selle – of dit 'n diersel of 'n plantsel is.
Wat is plant-DNA-ekstraksie?
DNS in plantselle word vir verskeie molekulêre studies onttrek. Dit word vereis om ongeskonde, suiwer genomiese DNA te onttrek. Daarom is daar verskillende tipes DNA-ekstraksieprotokolle wat verskil van die DNA-ekstraksieprotokolle van dierselle. Dit is omdat plantselle 'n selwand het wat gebreek moet word om sellulêre inhoud uit te haal.
Onttrekking word gewoonlik gedoen deur die plantweefsels in droë ys of vloeibare stikstof te maal met 'n vysel en stamper. Dan word die selmembrane ontwrig, en die sellulêre inhoud word in 'n ekstraksiebuffer uitgeneem. Dit word gewoonlik met 'n skoonmaakmiddel gedoen; SDS (natriumdodesielsulfaat) of CTAB (setieltrimetielammoniumbromied) buffer. Die vrygestelde DNA word beskerm teen endogene nukleases deur 'n chelaatvormende middel soos EDTA te gebruik. Boonop word proteïene van DNA geskei met behulp van chloroform of fenol.
Figuur 01: Plant-DNA-ekstraksie
Plante sintetiseer polisakkariede en polifenole, insluitend flavonoïede en ander sekondêre metaboliete. Hierdie verbindings meng in met die ekstraksie van suiwer genomiese DNA. Gevolglik behels die meeste plant-DNA-ekstraksieprotokolle nog 'n stap, soos sesiumchlorieddigtheidgradiënttegniek om hierdie verbindings uit te skakel.
Die meeste van die DNS-ekstraksieprotokolle beveel aan om vars blaarmonsters vir DNS-ekstraksie te gebruik. Sommige metodes sluit nie gevaarlike chemikalieë soos vloeibare stikstof en fenol in nie. CTAB (Cetyl trimethylammonium bromide) protokol is 'n gewilde plant DNA ekstraksie protokol wat die ekstraksie van hoë kwaliteit plant genomiese DNA fasiliteer. Dit is 'n eenvoudige, veilige, betroubare en kostedoeltreffende metode vir plant-DNS-ekstraksie. Die meeste van die ander metodes is gewysigde weergawes van die CTAB-metode.
Wat is diere-DNA-ekstraksie?
Diere-DNS-ekstraksie is die onttrekking van genomiese DNA uit dierselle vir molekulêre analise. Anders as plant-DNS-ekstraksie, is afbreek van die selwand nie nodig vir dierselle nie, aangesien hulle nie 'n selwand het nie. Bloedselle is die mees algemene tipe dierselle wat vir verskeie doeleindes gebruik word.
Figuur 02: DNA-ekstraksie
Die fenol-chloroform-metode is een van die beste keuses vir bloedselle. Die opbrengs en kwaliteit van DNS is hoog wanneer DNS uit hierdie metode onttrek word. Dit is 'n vloeistof-vloeistof DNA ekstraksie protokol, en hierdie metode skei DNA molekules op grond van hul oplosbaarheid in onmengbare oplossings. Fenol, chloroform en isoamiel alkohol is die top drie bestanddele van hierdie metode.
Wat is die ooreenkomste tussen plant- en diere-DNA-ekstraksie?
- Tydens beide plant- en diere-DNS-ekstraksie moet selmembrane ontwrig word.
- Die DNA moet teen endogene nukleases beskerm word.
- Boonop moet die skeer van die DNS voorkom word.
- Kommersiële stelle is beskikbaar vir die onttrekking van plant-DNA en diere-DNS.
- Die meeste plant- en diere-DNA-ekstraksiemetodes benodig deurlopende modifikasie en standaardisering.
Wat is die verskil tussen plant- en diere-DNA-ekstraksie?
Die sleutelverskil tussen plant- en dier-DNA-ekstraksie is dat plant-DNS-ekstraksie die maal van plantweefsel in droë ys of vloeibare stikstof vereis om die selwand te breek, terwyl diere-DNA-ekstraksie nie hierdie stap vereis nie, aangesien hulle dier selle het nie 'n selwand nie. CTAB-metode is een van die beste metodes vir plant-DNA-ekstraksie terwyl die fenol-chloroform-metode een van die beste metodes vir diere-DNS-ekstraksie is.
Infografika hieronder tabelle die verskille tussen plant- en dier-DNS-ekstraksie.
Opsomming – Plant vs Dier-DNA-ekstraksie
Verskillende metodes is beskikbaar vir die onttrekking van DNA uit verskillende seltipes. Daarom verskil plant-DNA-ekstraksieprotokolle van dieresel-DNA-ekstraksieprotokolle. Plant-DNA-ekstraksie vereis die ontwrigting van die selwand, selmembraan en kernmembraan terwyl diere-DNS-ekstraksie die afbreek van die selmembraan en kernmembraan vereis. Nog belangriker, diersel-DNS-ekstraksie vereis nie die ontwrigting van selwande deur droë ys of vloeibare stikstof te maal nie. Dit is dus die sleutelverskil tussen plant- en dier-DNS-ekstraksie.
