Die sleutelverskil tussen CRISPR en CRISPR Cas9 is dat CRISPR (gegroepeerde gereelde kort palindromiese herhaling) 'n natuurlik voorkomende prokariotiese immuunverdedigingsmeganisme is, terwyl CRISPR cas9 'n RNA-geleide Cas9-nuklease is wat deel is van die CRISPR-aanpasbare immuunstelsel.
CRISPR is 'n antivirale verdediging-immuunstelsel wat in bakterieë en archaea voorkom. Dit is 'n familie van DNS-volgordes wat in die bakteriese genoom voorkom. Dit bestaan uit spasieervolgordes wat afgelei is van DNA-fragmente van bakteriofage wat hulle voorheen besmet het. In daaropvolgende virale infeksies gebruik bakterieë hierdie volgordes om virale DNA te vernietig. CRISPR-reekse het kort palindromiese herhalings en spasieerreekse. Boonop het CRISPR herhalende spasieervolgordes dikwels geassosieerde gene wat vir Cas-proteïene kodeer. Cas9 is 'n RNA-geleide endonuklease. Saam met CRISPR-volgordes dien Cas9-proteïen as 'n aanpasbare immuunstelsel in bakterieë teen bakteriofage.
Wat is CRISPR?
CRISPR staan vir Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats. Dit is 'n groep DNA-volgordes wat in die bakteriese genoom voorkom. Dit werk as 'n natuurlike verdedigingsmeganisme in bakterieë, en dit is die eerste keer in E. coli geïdentifiseer. By bakterieë dien dit as aanpasbare immuunbeskerming, veral teen bakteriofage. Daarom is dit 'n volgorde-spesifieke meganisme.
Figuur 01: CRISPR
Die CRISPR-stelsel bevat verskeie kort-gesegmenteerde DNA-herhalingsreekse. Hierdie herhalings is palindromies, met dieselfde basisvolgorde wanneer jy van 5' tot 3' lees, terwyl die ander dieselfde volgorde gee wanneer jy van 3' tot 5' lees. Boonop is herhalings identies. Hulle is geleë tussen kort "spacer" DNS-volgordes wat nie identies is nie. Maar hierdie spasieerder-DNA-volgordes stem ooreen met of pas by vreemde bakteriofaag-DNS. Gene wat met CRISPR geassosieer word, staan bekend as CRISPR-geassosieerde gene of Cas-gene. Cas-gene kodeer vir Cas-proteïene wat helikases of nukleases is. Helikases ontspan DNA terwyl nukleases DNA sny. In die algemeen, wanneer die CRISPR oorweeg word, is dit 'n immuunstelsel van bakterieë wat werk teen bakteriofage (bakterieë wat virusse besmet).
Wat is CRISPR Cas9?
Cas9 of CRISPR-geassosieerde proteïen 9 is 'n bakteriese RNA-geleide endonuklease. Daarom is dit 'n ensiem wat teiken-DNA (veral bakteriofaag-DNA) herken en sny, komplementêr tot die gids-RNA. Dit voer streng-spesifieke splitsing uit. Cas9-proteïen word gekodeer deur 'n CRISPR-geassosieerde geen. CRISPR cas9 is die RNA-geleide CRISPR-Cas9 nukleasestelsel wat gebruik kan word as 'n RNA-programmeerbare DNA-teiken- en redigeringsplatform vir genoomredigering, transkripsie-versteuring, epigenetiese modulasie en genoombeelding. Hierdie CRISPR cas9-stelsel is baie gewild in huidige genoomredigeerstelsels.
Figuur 02: CRISPR Cas9
Op die oomblik word die CRISPR/Cas9-stelsel gebruik om die soogdiergenoom te verander of te wysig deur óf transkripsie-onderdrukking óf aktivering. Die soogdierselle kan reageer op CRISPR/Cas9-gemedieerde DNA-breek deur 'n herstelmeganisme aan te neem. Dit kan óf gedoen word deur gebruik te maak van nie-homologe eindverbindingsmetode (NHEJ) óf homologiegerigte herstel (HDR). Albei hierdie herstelmeganismes vind plaas deur dubbelstrengige breuke in te voer. Dit lei tot redigering van soogdiere. NHEJ kan lei tot ablasie van geenmutasies en kan gebruik word om 'n verlies aan funksie-effekte te skep. HDR kan gebruik word vir die bekendstelling van spesifieke puntmutasies of die bekendstelling van DNA-segmente van verskillende lengtes. Tans word die CRISPR/Cas-stelsel gebruik in die velde van terapeutiese, biomediese, landbou- en navorsingstoepassings.
Wat is die ooreenkomste tussen CRISPR en CRISPR Cas9?
- Cas9 is deel van CRISPR Cas-stelsel.
- Crisper cas9-stelsel is 'n immuunstelsel wat natuurlik in bakterieë voorkom.
Wat is die verskil tussen CRISPR en CRISPR Cas9?
CRISPR is 'n groep DNS-volgordes wat in die bakteriële genoom voorkom wat as 'n natuurlike verdedigingstelsel teen bakteriofage werk. Dit bestaan uit gereeld gespasieerde kort palindromiese herhalings, spasieerders en geassosieerde gene. In teenstelling hiermee is cas9 'n CRISPR-geassosieerde proteïen 9, wat 'n RNA-geleide endonuklease-ensiem is. Dit herken en sny DNA-dubbelstringe virusse. Trouens, dit is deel van die CRISPR-verdedigingstelsel. So, dit is die belangrikste verskil tussen CRISPR en CRISPR cas9.
Opsomming – CRISPR vs CRISPR Cas9
CRISPR Cas-stelsel is 'n mikrobiese verdedigingstelsel. CRISPR is 'n groep DNA-volgordes wat bestaan uit palindromiese kort herhalings, spasieervolgordes en geassosieerde gene. Cas9 is een Cas-proteïen wat 'n RNA-geleide endonuklease is. CRISPR- en Cas9-proteïene maak 'n immuunstelsel wat teen bakteriofaaginfeksies in bakterieë werk. Cas9-proteïen is in staat om vreemde virale DNA te klief en dit te ontwrig. CrRNA lei cas9 om virale DNA te herken. Daarom is CRISPR cas9-stelsel 'n natuurlike immuunstelsel wat in bakterieë teen virusse voorkom. Dit is dus die opsomming van die verskil tussen CRISPR en CRISPR cas9.
