Die sleutelverskil tussen ZFN TALEN en CRISPR is dat ZFN 'n mensgemaakte geenredigeringstegniek is wat gebaseer is op sinkvingernukleases wat saamgestel is uit 'n sinkvingerdomein en 'n Fok1-endonukleasedomein. Intussen is TALEN 'n mensgemaakte geenredigeringstegniek gebaseer op samesmeltingsproteïene wat bestaan uit 'n bakteriële TALE-proteïen en Fok1-endonuklease, en CRISPR is 'n natuurlike RNA-gebaseerde bakteriële verdedigingsmeganisme wat deur twee tipes RNA's en geassosieerde Cas-proteïene aangedryf word.
Geenredigeergereedskap is gebaseer op die gemanipuleerde nukleases wat bestaan uit volgorde-spesifieke bindingsdomeine en nie-spesifieke DNA-splytingsmodules. ZFN, TALEN en CRISPR is drie tipes geenredigeringstegnieke. ZEN en TALEN is mensgemaakte stelsels, terwyl CRISPR 'n natuurlike stelsel is wat in bakterieë voorkom. Al drie stelsels herken volgordes en klief teiken-DNS. Sinkvingernukleases is saamgestel uit 'n sinkvingerdomein en Fok1 endonuklease. TALENs is saamgestel uit 'n bakteriese TALE-proteïen en Fok1-endonuklease. CRISPR is saamgestel uit twee RNA's (transaktiverende crRNA en 'n enkele gids-RNA).
Wat is ZFN?
ZFN is 'n geenredigeringsinstrument gebaseer op sinkvingernukleases. Sinkvingernukleases is chimeriese nukleases wat saamgestel is uit volgorde-spesifieke DNA-bindende domeine en nie-spesifieke DNA-splytingsdomeine van die FokI-beperkingsendonuklease. Dit is 'n mensgemaakte genoomredigeringstegnologie wat 'n wye reeks geenmodifikasies moontlik maak deur dubbelstring-breuke in DNA te veroorsaak.
Figuur 01: ZFN
ZFN is 'n belangrike hulpmiddel wanneer geteikende veranderinge in plante en verskeie gewasspesies bekendgestel word. Dit laat die inkorporering van waardevolle eienskappe in plante toe. Verder het ZFN 'n terapeutiese potensiaal aangesien dit in staat is om presiese genetiese modifikasie uit te voer om die simptome effektief uit te skakel.
Wat is TALEN?
Transkripsie-aktiveerder-agtige nukleases (TALEN) is 'n geen-redigeringsinstrument wat gebaseer is op chimeriese nukleases soortgelyk aan ZFN. Dit is ook 'n mensgemaakte genoom-redigeringstegnologie. TALEN veroorsaak geenmodifikasie deur dubbelstring-breuke in DNA te veroorsaak. TALENs is saamgestel uit volgorde-spesifieke DNA-bindende domeine wat saamgesmelt is met 'n nie-spesifieke DNA-splytingsmodule. Daarom het dit FokI-splytingsdomeine en DNA-bindende domeine wat van TALE-proteïene afgelei is.
Figuur 02: TALEN
TALE-proteïene kom natuurlik voor in die bakteriese genus Xanthomonas. Hierdie proteïene bevat DNA-bindende domeine wat bestaan uit 'n reeks van 33-35 aminosuurherhalingsdomeine. Een van die groot voordele van TALEN bo ZFN is dat die bindingspesifisiteit van die DNA-bindingsdomein in TALEN verander kan word deur veranderinge aan 33-34 aminosuurherhalings aan te bring.
Wat is CRISPR?
CRISPR staan vir Clustered Regulatory Interspaced Short Palindromic Repeats. Dit is 'n natuurlike RNA-gebaseerde verdedigingsmeganisme wat in bakterieë uitgevoer word. Trouens, dit is 'n genoom-redigeringsmeganisme wat veral teen virusse gebruik word. 'n Virus of 'n vreemde indringer kan hierdie stelsel in bakterieë aktiveer. CRISPR werk saam met die CRISPR-geassosieerde proteïen (Cas9).
CRISPR bestaan uit twee RNA's: transaktiverende crRNA en 'n enkele gids-RNA. Daarom is die herkenning van CRISPR afhanklik van beide hierdie RNA's. Wanneer virale DNA 'n bakteriële sel binnedring, produseer die CRISPR-lokus gids-RNA, wat Cas-proteïene begelei om virale DNA te bereik en te bind en op 'n spesifieke plek te splits. Sodra virale DNA geklief is, word dit onaktief as gevolg van die stilmaak van patogeniese DNA. Gevolglik vang, klief en inaktiveer die CRISPR-stelsel virusse met behulp van Cas-proteïene.
Figuur 03: CRISPR/Cas9
CRISPR/Cas9 word as 'n genoomredigeringstelsel gebruik. Dit is 'n onlangse tegnologie. Hierdie tegnologie is baie eenvoudig, doeltreffend en koste-effektief bo ander genoom redigering tegnieke. In vergelyking met ZFN en TALEN, is CRISPR/Cas9-stelsel 'n doeltreffende hulpmiddel om geteikende genoomveranderinge te veroorsaak.
Wat is die ooreenkomste tussen ZFN TALEN en CRISPR?
- ZFN, TALEN en CRISPR is geenredigeringstegnieke.
- Al drie instrumente sal belowende tegnieke wees om die genetiese oorsake agter baie siektes reg te stel.
- Hulle toon egter beperkings in teiken, onvolmaakte spesifisiteit en geen-teikening.
- Al drie stelsels kan dubbelstring-breuke veroorsaak.
Wat is die verskil tussen ZFN TALEN en CRISPR?
ZFN is 'n geenredigeringstegniek gebaseer op sinkvingernukleases, terwyl TALEN 'n geenredigeringstegniek is gebaseer op samesmeltingsproteïene wat saamgestel is uit 'n bakteriële TALE-proteïen en Fok1-endonuklease, en CRISPR is 'n natuurlike RNA-gebaseerde bakteriële verdedigingsmeganisme wat aangedryf word deur twee tipes RNA en geassosieerde Cas-proteïene. So, dit is die belangrikste verskil tussen ZFN TALEN en CRISPR.
Die onderstaande infografika lys die verskille tussen ZFN TALEN en CRISPR in tabelvorm vir vergelyking langs mekaar.
Opsomming – ZFN vs TALEN vs CRISPR
ZFN, TALEN en CRISPR is geenredigeringstegnologieë. CRISPR is die onlangse tegnologie wat beter doeltreffendheid, uitvoerbaarheid en multi-rol kliniese toepassing toon. Beide ZFN en TALEN is mensgemaakte kunsmatige gereedskap, terwyl CRISPR 'n bakterieë verdedigingsmeganisme is. Beide ZFN en TALEN is vervaardigde nukleases. CRISPR bestaan uit twee RNA-tipes wat met Cas-proteïene assosieer. Dit is dus die opsomming van die verskil tussen ZFN TALEN en CRISPR.
