Die sleutelverskil tussen FISH en CGH is dat FISH 'n molekulêre tegniek is wat spesifieke DNS-volgorde op 'n chromosoom opspoor deur gebruik te maak van fluorescent-gemerkte probes, terwyl CGH 'n ander molekulêre sitogenetiese tegniek is wat veranderinge in die genomiese DNS opspoor.
Sitogenetiese analise speel 'n belangrike rol in medisyne by die opsporing van chromosomale abnormaliteite soos aneuploïdieë, delesies, dupliserings en herrangskikkings, ens. Chromosomale abnormaliteite lei uiteindelik tot genetiese siektes soos kanker, onvrugbaarheid, Down-sindroom, Klinefelter-sindroom, Turner sindroom, leukemie, ens. Daar is verskeie molekulêre sitogenetiese metodes om bogenoemde defekte en siektes op te spoor. Onder hulle is FISH (fluoresserende in situ hibridisasie) en CGH (vergelykende genomiese hibridisasie) twee kragtige hibridiseringstegnieke. Albei metodes het egter voor- en nadele.
Wat is VIS?
FISH is 'n nukleïensuur hibridisasie tegniek wat uitgevoer word op 'n gedeelte of gedeelte van weefsel, in die hele weefsel of selle. Dit is 'n sonde-gebaseerde metode. Die tegniek hang af van die teorie van Watson Crick komplementêre basisparing, wat lei tot óf DNA – DNA-basters óf DNA – RNA-basters, wat dus gemuteerde gene kan opspoor of die geen van belang kan identifiseer. Verder gebruik hierdie tegniek enkelstring-DNS-volgordes, dubbelstring-DNS-volgordes, enkelstrengs-RNA-volgorde of sintetiese oligonukleotied wat voorberei is deur gebruik te maak van nick-translasie as probes wat komplementêr is tot geenvolgorde van belang. Boonop is die belangrikste kenmerk van hierdie tegniek die etikettering van probes met fluoressensie kleurstowwe. Sodoende bind die probes met die komplementêre dele van die chromosoom en maak dit maklik vir opsporing.
Boonop is FISH 'n hoogs sensitiewe en spesifieke metode. Daarom is dit 'n algemene tegniek in beide navorsing en diagnose van hematologiese maligniteite en soliede gewasse. Maar, FISH toon lae resolusie. Dit vereis ook voorafkennis van die teikenabnormaliteit om sondereekse te ontwerp.
Figuur 01: VIS
Daar is baie toepassings van FISH, hoofsaaklik in die molekulêre diagnostiek van aansteeklike siektes om die teenwoordigheid van patogene te identifiseer en om die patogeen deur middel van molekulêre diagnostiek te bevestig. Boonop is FISH 'n tegniek wat algemeen gebruik word in die velde van ontwikkelingsbiologie, kariotipering en filogenetiese analise en fisiese kartering van chromosome.
Wat is CGH?
Vergelykende genomiese hibridisasie (CGH) is 'n ander DNA-gebaseerde molekulêre sitogenetiese tegniek wat die veranderinge van genomiese DNA-volgordes kan opspoor. Die metode is 'n gevorderde metode wat chromosoom- en geenmodifikasies kan analiseer om die veranderinge of veranderinge in die genomiese DNS-volgordes op te spoor. Verder vereis CGH die isolasie en fragmentasie van DNA van die eksperimentele monster en verwysing monster. Dan moet die monsters gemerk word met twee verskillende fluoresserende kleurstowwe (gewoonlik rooi en groen). Later word beide monsters gemeng en toegelaat vir mededingende hibridisasie. Die laaste stap is die ontleding van die monsters vir veranderinge in DNA soos geenduplisering, geenverlies, ens. Dit meet veral die DNA-kopiegetalverskille tussen die toetsmonster en die kontrolemonster.
Figuur 02: CGH
Nog 'n weergawe van CGH is nou beskikbaar; dit is 'n meer gevorderde metode as die normale CGH. Dit is 'n tegniek genaamd array-based CGH of aCGH. aCGH laat die presiese identifikasie van geen- of volgorde-delesies in baie duisend rye in een enkele eksperiment toe.
Wat is die ooreenkomste tussen FISH en CGH?
- FISH en CGH is twee molekulêre tegnieke.
- Beide FISH en CGH maak staat op nukleïensuurhibridisasie.
- Albei tegnieke benodig ook ontwerpte sondes om spesifieke DNS-teikens op te spoor.
- Ons gebruik dit vir voorgeboortelike en postnatale diagnose van genetiese siektes.
- Verder is beide FISH en CGH baie kragtige instrumente om genomiese veranderinge te bestudeer.
- Hulle gebruik fluoresserende kleurstowwe om probes te merk.
Wat is die verskil tussen FISH en CGH?
FISH is 'n in situ hibridisasieprosedure wat fluoresserende probes gebruik om spesifieke DNS-volgordes op te spoor, terwyl CGH 'n molekulêre hibridisasietegniek is wat die veranderinge van genomiese DNS-volgordes opspoor. So, dit is die belangrikste verskil tussen FISH en CGH.
Boonop vereis FISH voorafkennis van die teikenabnormaliteit om proefreekse te ontwerp, terwyl CGH nie voorafkennis vereis nie. 'n Verdere verskil tussen FISH en CGH is ook dat FISH beperkte resolusie toon terwyl aCGH hoë resolusie toon.
Die onderstaande infografika som die verskil tussen FISH en CGH op.
Opsomming – FISH vs CGH
FISH en CGH is twee molekulêre sitogenetiese tegnieke wat die opsporing van geenvolgordes van belang vergemaklik. FISH fasiliteer die opsporing van spesifieke DNS-volgorde op 'n chromosoom deur gebruik te maak van fluoressent gemerkte probes, terwyl CGH die opsporing van veranderinge in die genomiese DNS fasiliteer. So, dit is die belangrikste verskil tussen FISH en CGH.
