Sleutelverskil – VNTR vs STR
DNA-studies het groot nut om filogenetiese verwantskappe te verstaan en te bepaal, genetiese siektes te diagnoseer en organisme se genome te karteer. Verskeie tegnieke wat met DNS-analise geassosieer word, word gebruik vir die identifikasie van 'n bepaalde geen of 'n DNS-volgorde in 'n poel van onbekende DNS. Hulle staan bekend as genetiese merkers. Genetiese merkers word in molekulêre biologie gebruik om genetiese variasie tussen individue en spesies te identifiseer. Veranderlike aantal tandem herhaling (VNTR) en kort tandem herhaling (STR) is twee tipes genetiese merkers wat polimorfisme onder individue toon. Beide tipes is nie-koderende herhalende DNA wat tandem herhalings is. Hulle is in 'n kop tot stert-mode in chromosome gerangskik. VNTR is 'n gedeelte van die genoom waar kort nukleotiedvolgorde verskeie kere herhaal word. STR is 'n ander deel van DNS binne die genoom wat georganiseer is as herhalende eenhede wat bestaan uit twee tot dertien nukleotiede in honderd keer. Die belangrikste verskil tussen VNTR en STR is die aantal nukleotiede in 'n herhalende volgorde. Herhalende eenhede van VNTR bestaan uit 10 tot 100 nukleotiede terwyl herhalende eenheid van STR uit 2 tot 13 nukleotiede bestaan. VNTR en STR word wyd in forensiese studies gebruik.
Wat is VNTR?
'n Tandem-herhaling is 'n kort reeks DNS wat kop tot stert by 'n spesifieke chromosomale lokus herhaal word. Daar is geen ander volgorde of nukleotied binne die tandem-herhaling nie. Daar is verskeie tipes tandem-herhalings in die genoom. VNTR is 'n tipe tandem-herhaling onder hulle wat herhalende eenhede het wat bestaan uit 10 tot 100 nukleotiede. VNTR is 'n soort minisatelliet. Hierdie tandem-herhalings kan in baie chromosome gevind word. Hulle is in die menslike genoom afgewissel en is hoofsaaklik in die subtelomere streke van chromosome geleë.
VNTRs toon tandem herhaalde polimorfisme onder individue. Die lengte van die VNTR in 'n spesifieke plek van die chromosoom is hoogs veranderlik onder individue as gevolg van die variasie in die aantal herhalende eenhede wat in daardie DNA-afdeling georganiseer is. Daarom kan VNTR gebruik word as 'n kragtige instrument in die identifisering van individue en VNTR-analise word in baie velde gebruik, insluitend genetika, biologie-navorsing, forensiese en DNS-vingerafdrukke. VNTR's was die eerste genetiese merkers wat gebruik is om beenmurgoorplanting te kwantifiseer. VNTR's was ook die eerste polimorfiese merkers wat in DNS-profiele in forensiese ondersoeke gebruik is.
Figuur 01: Variasie van VNTR's in ses individue
VNTR-analise word uitgevoer via beperking fragment lengte polimorfisme gevolg deur suidelike hibridisasie. Daarom benodig dit relatief 'n groot DNA-monster. VNTR-profielinterpretasie is ook problematies. As gevolg van hierdie beperkings is die gebruik van VNTR in forensiese genetika beperk en dit word vervang deur STR-analise.
Wat is STR?
STR is 'n hoogs herhalende DNA-afdeling wat bestaan uit twee tot dertien nukleotied-herhalende eenhede wat in 'n tandem-manier georganiseer is. STR is soortgelyk aan VNTR. Maar dit verskil van VNTR van die aantal nukleotiede in 'n herhalende volgorde en die aantal herhalings. STR is 'n tipe mikrosatelliet.
STR-analise betrokke by die meting van die presiese aantal herhalende eenhede. STRs is hoogs veranderlik onder individue, soortgelyk aan VNTs. STR-profiele verskil van persoon tot persoon. Daarom word STR-analise in molekulêre biologie gebruik om spesifieke lokusse op DNA van twee of meer monsters te vergelyk. Daarom word STR's as kragtige genetiese merkers in molekulêre biologie beskou. Dit bied 'n uitstekende hulpmiddel vir die identifisering van individue vanweë hul hoë graad van polimorfisme en relatief kort lengte.
Op die oomblik is STR's die mees gebruikte instrument vir geanaliseerde genetiese polimorfisme in forensiese genetika. Die meeste forensiese gevallewerk behels STR-polimorfiese analise. STR-lokusse is deur die genoom versprei. Daar is duisende STR's in chromosome wat in forensiese analise gebruik kan word. STR-analise behels nie beperkingslengte-polimorfisme soos VNTR-analise nie. STR-analise sny nie DNA met beperkingsensieme nie. Spesifieke probes word gebruik om verlangde streke op DNA te heg en met behulp van PCR-tegniek word die lengtes van die STR bepaal.
Figuur 02: STR-variasie tussen monsters
Wat is die ooreenkomste tussen VNTR en STR?
- VNTR en STR is niekoderende DNA.
- Albei is tandem-herhalings.
- Albei toon polimorfisme onder individue as gevolg van die verskil in die lengte van die DNA-afdeling.
- Albei word gebruik as kragtige genetiese merkers in DNS-vingerafdrukke en in forensiese studies.
Wat is die verskil tussen VNTR en STR?
VNTR vs STR |
|
| VNTR is 'n nie-koderende herhalende DNA wat 'n kort nukleotiedvolgorde het wat op 'n tandem wyse herhaal word. | STR is 'n hoogs herhalende DNA-afdeling wat bestaan uit twee tot dertien nukleotied-herhalende eenhede wat in 'n tandem-manier georganiseer is. |
| Size | |
| VNTR'e is groter as STR'e. | STR'e is kleiner as VNTR'e. |
| Aantal nukleotiede in herhalende volgorde | |
| Die herhalende eenheid van VNTR bestaan uit 10 tot 100 nukleotiede. | Die herhalende eenheid van STR bestaan uit 2 tot 13 nukleotiede. |
Opsomming – VNTR vs STR
VNTR en STR is twee kragtige genetiese merkers wat in molekulêre biologie gebruik word, veral in die veld van forensiese genetika. VNTR is 'n tipe minisatelliet en STR is 'n mikrosatelliet. VNTR en STR is nie-koderende, hoogs herhalende DNA. Hulle is tandem-herhalings. Die algemene struktuur van VNTR en STR is dieselfde. Die aantal nukleotiede in die herhalende volgorde en die lengte verskil egter. VNTR het herhalende rye wat bestaan uit 10 tot 100 nukleotiede. STR het herhalende rye wat uit 2 tot 13 nukleotiede bestaan. Dit is die verskil tussen VNTR en STR.
Laai PDF-weergawe van VNTR vs STR af
Jy kan die PDF-weergawe van hierdie artikel aflaai en dit vir vanlyn doeleindes gebruik soos per aanhalingsnotas. Laai asseblief PDF-weergawe hier af Verskil tussen VNTR en STR.
