Die sleutelverskil tussen gekonserveerde en konsensusvolgorde is dat gekonserveerde volgorde verwys na soortgelyke volgordes van nukleïensure of aminosure wat in verskillende of dieselfde spesies oor generasies voorkom, terwyl konsensusvolgorde 'n nukleotiedevolgorde of aminosuurvolgorde is wat algemeen voorkom. in 'n hoogs bewaarde gebied van DNA of RNA of proteïen.
Organismes deel soortgelyke sowel as verskillende eienskappe. Wanneer die verwantskappe tussen organismes bestudeer word en hulle geklassifiseer word, is genoom of genetiese samestelling van organismes baie belangrik. Daar is 'n paar nukleotied- of aminosuurvolgordes wat algemeen onder verskillende organismes voorkom.'n Bewaarde volgorde is 'n nukleïensuur- of aminosuurvolgorde wat konsekwent tussen spesies is. Daarom is hulle filogeneties belangrik wanneer filogenetiese bome gegenereer word. In gekonserverde rye is daar spesifieke nukleotiedvolgordes wat meer algemeen voorkom. Hulle staan bekend as konsensusreekse.
Wat is Conserved Sequence?
'n Bewaarde volgorde is 'n nukleïensuurvolgorde of aminosuurvolgorde wat soortgelyk is onder spesies. Daarom is dit konsekwent regdeur die spesie regdeur evolusie. Oor die algemeen word hierdie rye deur natuurlike seleksie in stand gehou. Hulle bly onveranderd ver agter in die filogenetiese boom. Daarom is bewaarde rye belangrik in die bou van filogenetiese bome. Daar word geglo dat hoogs bewaarde rye dikwels 'n belangrike funksionele waarde het. Hulle is ook nuttig om genetiese siektes te identifiseer. Bewaarde volgordes kan egter koderende of nie-koderende nukleïensuurvolgordes wees. Daarbenewens toon gekonserveerde volgordes stadiger mutasietempo's. Daarom toon hulle baie minimale veranderinge in hul samestelling; soms wys hulle nie veranderinge oor die geslagte heen nie.
Figuur 01: Conserved Sequence
RNA-komponente van ribosome is teenwoordig in alle lewensdomeine, die homeobox-volgordes in eukariote, en die tmRNA in bakterieë is verskeie voorbeelde van hoogs gekonserveerde rye. Identifisering van gekonserveerde volgordes is maklik wanneer bioinformatikabenaderings, veral die volgorde-belyningsinstrument, gebruik word. Boonop vergemaklik meervoudige volgordebelyning die visualisering van gekonserveerde rye.
Wat is konsensusvolgorde?
'n Konsensusvolgorde is 'n volgorde wat algemeen in 'n gegewe bewaarde gebied van DNA of RNA aangetref word. Dit is 'n baie spesifieke nukleotiedvolgorde. As 'n voorbeeld is daar 'n konsensusvolgorde by die -10 as TATAAT (Pribnow box) in E. coli promotors, wat hoogs gekonserveerde volgordes is. Net so is daar nog 'n konsensusvolgorde: TTGACA in E. coli promotors by die -35 ook. Konsensusreekse staan ook bekend as "kassies".
Figuur 02: Konsensusvolgorde
Benewens DNA en RNA, het proteïene ook konsensusvolgorde van aminosure. Proteïenbindingsplekke word dikwels deur konsensusvolgorde voorgestel. Beperkingsensieme het ook konsensusvolgorde. Boonop is splitsingsplekke ook konsensusvolgorde. Soortgelyk aan bewaarde rye, kan konsensus rye bereken en gevisualiseer word deur bioinformatika gereedskap.
Wat is die ooreenkomste tussen behoue en konsensusvolgorde?
- Bewaarde en konsensusvolgorde is nukleïensuur- of aminosurereekse wat algemeen oor spesies voorkom.
- Beide gekonserveerde en konsensusvolgorde kan deur bioinformatika-instrumente gevisualiseer word.
- Hulle word wyd gebruik in molekulêre biologie.
Wat is die verskil tussen behoue en konsensusvolgorde?
Die gekonserveerde volgorde is 'n nukleïensuur- of aminosuurvolgorde wat konsekwent tussen spesies is, terwyl konsensusvolgorde baie spesifiek is en basisse of aminosure wat algemeen voorkom in 'n gegewe bewaarde gebied. Dit is dus die sleutelverskil tussen bewaarde en konsensusvolgorde. Boonop is 'n ander verskil tussen gekonserveerde en konsensusvolgorde dat die gekonserveerde volgordes filogeneties belangrik is terwyl konsensusvolgorde dikwels proteïenbindingsplekke, splitsingsplekke, beperkingsensiem snyplekke, ens. is.
Opsomming – Conserved vs Consensus Sequence
Bewaarde rye is die volgordes van nukleïensure of proteïene wat soortgelyk is onder lewende spesies. 'n Promotor, ribosoombindingsplek, 'n oorsprong van replikasie en aminosuurvolgorde van histoonproteïen is verskeie voorbeelde van gekonserveerde volgordes. In teenstelling hiermee is konsensusvolgorde spesifieke basisse of aminosure wat meer algemeen in 'n gegewe bewaarde volgorde voorkom. -10 boks, -35 boks E. coli-promotor, proteïenbindingsplekke, splitsingsplekke en beperkingsensieme wat plekke herken is verskeie voorbeelde van konsensusvolgorde. Dit is dus die opsomming van die verskil tussen gekonserveerde en konsensusvolgorde.
