Die sleutelverskil tussen genomiese DNA en plasmied DNA-isolasie is dat die genomiese DNA-isolasie die ekstraksie van genomiese DNA teiken terwyl die plasmied DNA-isolasie die ekstraksie van plasmied DNA van die bakterieë teiken.
DNS-isolasie is 'n chemiese proses wat gebruik is om DNS van verskillende spesies of van verskillende monsters te isoleer. DNA-isolasie is belangrik in stroomaf molekulêre biologie tegnieke, soos gelelektroforese, polimerase kettingreaksie en DNA-volgordebepalingstegnieke. Daarom is isolasie van DNA 'n noodsaaklike chemiese proses in molekulêre biologiese studies. Gebaseer op die doel van die navorsing, is dit soms nodig om genomiese DNA te isoleer. Daarbenewens fokus sommige studies op die isolering van plasmied DNA van bakterieë. Genomiese DNA-isolasie is die proses om genomiese DNA van 'n prokariotiese of 'n eukariotiese monster te isoleer. Die stappe van isolasie verskil volgens die tipe sel waarin die DNA isoleer. Plasmied-DNA-isolasie is die proses om plasmied-DNS van 'n bakteriese sel te isoleer. In vergelyking met genomiese DNS-isolasie, is die algehele proses kompleks in plasmied DNS-isolasie.
Wat is Genomiese DNA-isolasie?
Genomiese DNA-isolasie is die proses om hele genomiese DNA van 'n organisme te onttrek. Hierdie spesifieke proses behels drie hoofgebeure. Dit is sellise of kernlise, proteïenafbraak of proteolise en presipitasie van genomiese DNA. Die lisestap kan verskil volgens die seltipe. In prokariote, aangesien daar 'n peptidoglikaan selwand is, moet die eerste stap die afbreek van die selwand wees. Aan die ander kant, in eukariote, behels die lisestap die afbreek van die plasmamembraan en die kernmembraan om die DNS na die buitekant uit te neem. Daarteenoor is spesiale stappe noodsaaklik om die plant- en swamselwande te lyseer.
Figuur 01: Genomiese DNA-isolasie
Gevolglik, sodra die lise-stap voltooi is, sal DNA uiteindelik na die supernatant kom. Gelyktydig vind proteïenafbraak ook in die oplossing plaas as gevolg van die byvoeging van proteïenase K. Volgende stap is om genomiese DNA en afgebreekte proteïene van mekaar te skei. Gevolglik skei die afgebreekte proteïene uit deur presipitasie wat die genomiese DNA in die supernatant laat bly. Na presipitasie van proteïene, kan genomiese DNA gepresipiteer en weer in 'n geskikte buffer gesuspendeer word totdat dit vir die eksperiment benodig word.
Genomiese DNA, wat lineêre DNA is, bevat al die genetiese inligting van 'n organisme. Met ander woorde, die genoom is die oorerflike materiaal van 'n lewende organisme wat verantwoordelik is vir al die strukturele en funksionele aktiwiteite van die sel. Dit bestaan uit beide koderende en nie-koderende DNA-volgordes. Wanneer genomiese DNA isoleer, sluit dit die hele genoom van die organisme in.
Wat is plasmied-DNA-isolasie?
Plasmied DNA-isolasie is 'n spesiale en meer ingewikkelde proses van DNA-isolasie. Plasmiede is ekstrachromosomale DNA wat in die meeste bakteriële selle voorkom. Hulle is dormante sirkelvormige DNA wat die bakterieë ondersteun om in moeilike omgewingstoestande te oorleef. Plasmied DNA bestaan uit spesiale weerstandbiedende gene wat addisionele voordele aan die bakterieë bied soos antibiotika weerstand, virulensie eienskappe en toksiese eienskappe.
Figuur 02: Plasmied DNA-isolasie
Plasmied-DNS-isolasie behels ook drie hoofprosesse; sellise, proteïenolise en DNA-presipitasie. Alhoewel die biochemiese meganisme van isolasie soortgelyk is aan dié van die genomiese DNS-isolasie, is die proses meer kompleks as dit. Die selliseproses is die belangrikste proses in hierdie prosedure. Die belangrikste is dat genomiese DNA en plasmied DNA nie met mekaar gemeng moet word nie. Daarom word 'n baie ligter lysisproses in die plasmied-DNA-isolasieprosedure ingesluit. Dus, in die meeste plasmied DNA isolasie prosedures gebruik die skoonmaakmiddel; natriumdodesielsulfaat vir sellise.
Wat is die ooreenkomste tussen genomiese DNA en plasmied DNA-isolasie?
- Genomiese DNA en Plasmied DNA-isolasie fokus op die onttrekking van DNA van 'n organisme.
- Albei volg ook dieselfde algehele proses wat sellise, proteïenafbraak en DNA-neerslag insluit.
- Verder is die gevolglike DNS van beide prosesse belangrik vir stroomaf-prosesse.
- Boonop sluit beide isolasieprosesse die stappe in om die DNA onder gespesifiseerde bergingstoestande te suiwer en te berg.
- Boonop word proteïenase K in beide metodes gebruik om proteïene af te breek.
Wat is die verskil tussen genomiese DNA en plasmied DNA-isolasie?
Genomiese DNA-isolasie fokus op die onttrekking van hele genomiese DNA van die teikenorganisme terwyl die plasmied-DNS-isolasie fokus op die isolering van slegs plasmied-DNS van die spesifieke bakteriese spesie. Daarom is dit die belangrikste verskil tussen genomiese DNA en plasmied DNA-isolasie. Boonop is 'n ander verskil tussen genomiese DNA en plasmied DNA-isolasie in die prosedure. Die genomiese DNA isolasie is 'n minder komplekse prosedure in vergelyking met plasmied DNA isolasie. Dus, wanneer plasmied DNA isoleer, is dit nodig om voorsorgmaatreëls te tref om die vermenging van genomiese en plasmied DNA met mekaar te voorkom.
Die onderstaande infograohic verskaf verdere besonderhede oor die verskil tussen genomiese DNA en plasmied DNA-isolasie.
Opsomming – Genomiese DNA vs Plasmied DNA-isolasie
DNA-isolasie is 'n belangrike proses in molekulêre biologie tegnieke. Daar is twee tipes DNA, naamlik genomiese DNA en plasmied DNA (ekstra-chromosomale DNA). Gebaseer op die vereiste, is sommige prosedures uitgevoer om genomiese DNA te isoleer, terwyl sommige prosedures daarop fokus om slegs plasmied DNA van bakterieë te isoleer. Die stappe wat by beide prosesse betrokke is, verskil dus effens van mekaar. Die algehele proses is egter dieselfde in beide isolasies. Geïsoleerde DNA van beide prosesse het groot gebruik in stroomaf prosesse soos kloning, gelelektroforese en polimerase kettingreaksies. Aan die einde van die genomiese DNA isolasie protokol kan die hele genomiese DNA van die organisme as die finale produk geïsoleer word terwyl aan die einde van die plasmied DNA isolasie protokol die plasmied DNA van die onderskeie bakterie as die finale produk geïsoleer kan word. Daarom is dit die verskil tussen genomiese DNA en plasmied DNA isolasie.
