Die sleutelverskil tussen halorhodopsin en bakteriorodopsien is dat halorhodopsien 'n liggedrewe chloriedpomp is wat in archaea voorkom, terwyl bakteriorodopsien 'n liggedrewe protonpomp is wat in archaea voorkom.
Halorhodopsin en bacteriorhodopsin is heptaheliese membraanproteïene. Hulle staan ook bekend as archaea rhodopsins. Oor die algemeen word albei in die pers membraan aangetref, 'n deel van die Halobacterium salinarum selmembraan. Halorhodopsin is 'n liggedrewe chloriedpomp wat ione toelaat om van die ekstrasellulêre kant na die sitoplasmiese kant te vloei. Aan die ander kant is bakteriorodopsien 'n liggedrewe protonpomp wat ione toelaat om van die sitoplasmiese kant na die ekstrasellulêre kant te vloei. Daarom is halorhodopsin en bacteriorhodopsin twee liggedrewe ioonbulte wat in archaea gevind word, veral in halobakterieë.
Wat is Halorhodopsin?
Halorhodopsin is 'n retinale proteïen van archaeon Halobacterium salinarum, wat die energie van groen lig (500 tot 650nm) gebruik om chloriedione in die sel te vervoer teen die membraanpotensiaal. Die opname van kaliumchloried deur hierdie selle deur ionepompe soos halorhodopsin is nodig om osmotiese balans tydens selgroei te handhaaf. Boonop bespaar 'n liggedrewe anioonpomp 'n aansienlike hoeveelheid metaboliese energie. Halorhodopsin vou in 'n sewe-transmembraan helikstopologie met kort onderling verbindende lusse. Die helikse (genoem A tot G) is in 'n boogagtige struktuur gerangskik en omring 'n retinale molekule wat kovalent gebind is via 'n Schiff-basis aan 'n gekonserveerde lisienaminosuur (Lys-242) op heliks G. Die dwarssnit van halorhodopsien met residue is belangrik vir chloriedoordrag. Dit is die waarskynlike pad van die anioon.
Figuur 01: Halorhodopsin
Die absorpsie van 'n foton deur halorhodopsin begin 'n katalitiese siklus, wat lei tot die vervoer van 'n anioon in die sel. Die siklus kan beskryf word in terme van ses stappe van isomerisasie (I), ioonvervoer (T), en toeganklikheidsverandering (skakelaar S). Verder is 'n belangrike metode vir ontleding van halorhodopsien struktuur en funksie die moontlikheid om spesifiek gemodifiseerde proteïen te produseer deur plekgerigte mutagenese en homoloë ooruitdrukking.
Wat is Bacteriorhodopsin?
Bacteriorhodopsin is bekend as 'n liggedrewe protonpomp in archaea soos Halobacterium salinarum. Bacteriorhodopsin is 'n proteïen wat deur archaea gebruik word, veral deur halobakterieë, 'n klas van Euryarchaeota. Dit dien as 'n protonpomp wat ligenergie opvang en hierdie energie gebruik om protone oor die membraan uit die sel te beweeg. Die resulterende protongradiënt word daarna in chemiese energie omgeskakel.
Figuur 02: Bacteriorhodopsin
Bacteriorhodopsin is 'n 27 kDa integrale membraanproteïen. Die herhalende element van die seskantige rooster is saamgestel uit drie identiese proteïenkettings, elk met 120 grade geroteer in verhouding tot die ander. Boonop het elke monomeer sewe transmembraan alfa-helikse en 'n ekstrasellulêre tweestrengige beta-vel. Verder word die proteïen-motorkrag wat deur hierdie retinale proteïen gegenereer word deur ATP-sintase gebruik om ATP te genereer. Deur bakteriorodopsien uit te druk, is die archaea-selle dus in staat om ATP te sintetiseer in die afwesigheid van 'n koolstofbron.
Wat is die ooreenkomste tussen Halorhodopsin en Bacteriorhodopsin?
- Halorhodopsin en bacteriorhodopsin behoort aan 'n subfamilie van heptaheliese membraanproteïene.
- Albei is retinale proteïene.
- Hulle staan ook bekend as archaea rhodopsins.
- Hulle is liggedrewe ioonbulte.
- Albei is teenwoordig in die pers membraan, 'n deel van die Halobacterium salinarum selmembraan.
- Hulle het spesifieke funksies wat baie belangrik is vir die oorlewing van halobakterieë.
Wat is die verskil tussen Halorhodopsin en Bacteriorhodopsin?
Halorhodopsin is 'n liggedrewe chloriedpomp wat in archaea aangetref word, terwyl bacteriorhodopsin 'n liggedrewe protonpomp is wat in archaea voorkom. Dit is dus die belangrikste verskil tussen halorhodopsin en bacteriorhodopsin. Verder is halorhodopsin 'n liggedrewe chloriedpomp wat ione toelaat om van die ekstrasellulêre na die sitoplasmiese kant te vloei. Aan die ander kant is bakteriorodopsien 'n liggedrewe protonpomp wat ione toelaat om van die sitoplasmiese na die ekstrasellulêre kant te vloei.
Die onderstaande infografika bied die verskille tussen halorhodopsin en bacteriorhodopsin in tabelvorm aan vir vergelyking langs mekaar.
Opsomming – Halorhodopsin vs Bacteriorhodopsin
Halorhodopsin en bacteriorhodopsin is twee liggedrewe ioonbulte wat in archaea voorkom, veral halobakterieë. Halorhodopsin is 'n liggedrewe chloriedpomp, terwyl bakteriorodopsien 'n liggedrewe protonpomp is. Halorhodopsin laat ioonvloei van die ekstrasellulêre na die sitoplasmiese kant toe. In teenstelling hiermee laat bakteriorodopsien ioonvloei van die sitoplasmiese na die ekstrasellulêre kant toe. Dus, dit som die verskil tussen halorhodopsin en bacteriorhodopsin op.
