Die sleutelverskil tussen T4 DNA-ligase en E. coli DNA-ligase is dat T4 DNA-ligase 'n ensiem is wat uit bakteriofaag T4 geïsoleer word, terwyl E. coli DNA-ligase 'n ensiem is wat van die bakterie E. coli geïsoleer is..
DNA-ligase is 'n spesifieke tipe ensiem wat die binding van DNA-stringe fasiliteer deur die vorming van 'n fosfodiesterbinding. Dit speel 'n belangrike rol deur enkelstring-breuke en dubbelstring-breuke in die DNA van lewende organismes te herstel. Boonop word DNA-ligase gebruik in beide DNA-herstel en DNA-replikasie. Afgesien van die bogenoemde gebruike, het DNA-ligase ook uitgebreide gebruik in molekulêre biologie-eksperimente soos rekombinante DNA-tegnologie. T4 DNA-ligase en E. coli DNA-ligase is twee tipes DNA-ligase-ensieme.
Wat is T4 DNA Ligase?
T4-ligase is 'n DNA-koppelende ensiem wat uit bakteriofaag T4 geïsoleer is. T4-bakteriofaag is 'n virus wat Escherichia coli infekteer. T4-ligase-ensiem is die DNS-ligase wat die meeste in molekulêre biologiese laboratoriumnavorsing gebruik word. Normaalweg kataliseer T4-ligase die binding van twee samehangende of stomp-einde stringe van dubbelstring DNA tussen die 5' fosfaat en 3' hidroksielgroepe van aangrensende nukleotiede. Dit kan ook die binding van RNA aan óf 'n DNA- óf RNA-string in 'n dupleksmolekule kataliseer. Hierdie ensiem sal egter nie by enkelstrengige nukleïensure aansluit nie. Boonop kan dit ook DNS met stompe eindes met baie groter doeltreffendheid as E. coli DNS-ligase ligeer.
Figuur 01: T4 DNA Ligase
Hierdie ensiem vereis ATP as 'n kofaktor. Sommige genetiese ingenieurswese-navorsingseksperimente het reeds meer aktiewe DNA-ligase-ensieme as wilde-tipe T4-DNS-ligase geproduseer. In een van die benaderings het hulle 'n samesmelting-ensiemmolekule geskep deur T4 DNA-ligase te kam na óf p50 óf NF-kB molekule. Hierdie nuwe T4-ligase-ensiem was 160% meer aktief in stomp-end-ligasies vir kloningsdoeleindes as wilde-tipe T4 DNA-ligase. Verder is die optimale temperatuur vir T4 DNA-ligase om die ligasiereaksie meer presies te kataliseer, 16 °C.
Wat is E Coli DNA Ligase?
E. coli DNA-ligase is 'n ensiem wat van E. coli-bakterieë geïsoleer word. Die geen verantwoordelik vir die maak van E. coli DNA ligase is lig geen. Die E. coli DNA, ligase sowel as die meeste prokariote DNA ligases, gebruik energie wat deur NAD (nikotinamied adenien dinukleotied) verkry word om die fosfodiester binding te skep.
Figuur 02: E. Coli DNA Ligase
E. coli DNA-ligase is 'n ligasie-ensiem wat DNA-fragmente kan verbind deur die vorming van fosfodiesterbindings tussen dubbelstring-DNS-fragmente wat 5' fosfaattermini en 3' hidroksieltermini bevat, te kataliseer. Boonop lig dit nie DNA met stompe eindes nie, behalwe onder spesiale toestande soos molekulêre ophoping met poliëtileenglikol. Dit kan ook nie RNA doeltreffend by DNA verbind nie. Verder kan die aktiwiteit van E. coli DNA-ligase versterk word deur die teenwoordigheid van DNA-polimerase 1 by die regte konsentrasie. Wanneer die konsentrasie van DNA-polimerase 1-ensiem egter hoër is, het dit nadelige effekte op E. coli DNA-ligase-aktiwiteit.
Wat is die ooreenkomste tussen T4 DNA Ligase en E Coli DNA Ligase?
- T4 DNA-ligase en E-coli DNA-ligase is twee tipes DNA-ligase-ensieme.
- Albei is proteïene wat uit aminosure bestaan.
- Hierdie ensieme kataliseer die vorming van 'n fosfodiester-binding tussen langs mekaar geplaasde 5'-fosfaat- en 3'-hidroksieltermini in dupleks-DNS.
- Hulle het uitgebreide gebruike in molekulêre biologie-eksperimente soos rekombinante DNA-tegnologie.
Wat is die verskil tussen T4 DNA Ligase en E Coli DNA Ligase?
T4 DNA-ligase is 'n ensiem wat uit bakteriofaag T4 geïsoleer word, terwyl E. coli DNA-ligase 'n ensiem is wat van E. coli-bakterieë geïsoleer is. Dit is dus die sleutelverskil tussen T4 DNA-ligase en E. coli DNA-ligase. Verder is die bron van energie vir T4 DNA-ligase ATP. Aan die ander kant is die bron van energie vir E. coli DNA-ligase NAD.
Die onderstaande infografika bied die verskille tussen T4 DNA-ligase en E coli DNA-ligase in tabelvorm aan vir vergelyking langs mekaar.
Opsomming – T4 DNA Ligase vs E Coli DNA Ligase
T4 DNS-ligase en E. coli DNS-ligase is twee ensieme wat die vorming van 'n fosfodiester-binding tussen langs mekaar geplaasde 5'-fosfaat- en 3'-hidroksieltermini in dupleks-DNS kataliseer. T4-ligase is 'n ensiem wat uit bakteriofaag T4 geïsoleer word, terwyl E. coli DNA-ligase 'n ensiem is wat van E. coli-bakterieë geïsoleer is. So, dit is die sleutelverskil tussen T4 DNA-ligase en E coli DNA-ligase.