Die sleutelverskil tussen hiërargiese en heelgenoom haelgeweervolgordebepaling is dat in hiërargiese haelgeweervolgordebepaling, die genoom in groter fragmente opgebreek word voor volgordebepaling terwyl, in heelgenoom haelgeweervolgordebepaling, die hele genoom in klein fragmente opgebreek word vir volgordebepaling.
Opeenvolging is 'n belangrike tegniek in molekulêre prosesse, veral in die akkurate identifikasie van spesies. Trouens, dit is die tegniek om die presiese volgorde van nukleotiede in 'n geen of 'n genoom te identifiseer. Daar is baie tegnieke vir volgordebepaling. Sommige hiervan sluit in Maxam Gilbert-metode, Sanger-metode en outomatiese Sanger-metode.
Wat is hiërargiese haelgeweervolgorde?
Hierargiese haelgeweer-volgordebepaling is een metode van volgordebepaling. Dit word ook 'top-down volgorde' genoem. Verder bestaan hierdie metode uit twee stappe: die eerste stap is genoomamplifikasie, en die tweede stap is genoomfragmentasie. In hierdie metode word die genoom eers in groot fragmente geskeer. Dit word gevolg deur die kloning van hierdie groot fragmente in verskeie gashere met behulp van vektore of kunsmatige chromosome. Dan word hierdie rekombinante vektore in 'n biblioteek gerangskik. Tydens die haelgeweervolgordebepaling ondergaan die rekombinante vektorklone individueel volgordebepaling. Die fragmente in die klone ondergaan beperkingsvertering om die grootte van die genoom verder te verminder, en daardeur volgordebepaling ondergaan.
Figuur 01: Hiërargiese haelgeweervolgorde
Tydens hiërargiese haelgeweer-volgordebepaling, moet die groot stukke fragmente in volgorde gerangskik word, voor die haelgeweer-volgorde. Dit vind plaas met behulp van die molekulêre merkers wat tydens die kloningsproses geïnkorporeer word.
Hierargiese haelgeweervolgorde skep 'n lae-resolusie geenkaart. Maar dit skep 'n geordende volgordekaart. Dit neem dus 'n langer duur as direkte volgordebepaling. Die hele proses vertraag as gevolg van die skep van 'n rekombinante vektorbiblioteek. Is dit ook 'n arbeidsintensiewe tegniek. Tans is die tegniek egter geoutomatiseer om die werk te vergemaklik.
Wat is Whole Genome Haelgeweer-volgordebepaling?
Heelgenoom-haelgeweer-volgordebepaling is 'n enkelstap-volgordebepalingsproses. In hierdie proses vind die hele genoomskeer eers plaas. Hierna ondergaan elkeen van hierdie klein fragmente lukraak volgordebepaling. Na voltooiing van die volgordebepaling vind die volgorde-analise plaas. Tydens volgorde-analise word die oorvleuelende rye verwyder, en die analise is nie 'n geordende proses nie. Daarom is die samestelling van rye 'n minder doeltreffende proses in vergelyking met hiërargiese haelgeweervolgorde. Die proses van heelgenoom-haelgeweervolgordebepaling is egter vinniger, en die ontleding van die hele genoom kan in 'n enkele geval plaasvind.
Wat is die ooreenkomste tussen hiërargiese en heelgenoom-haelgeweervolgorde?
- Hierargiese en heelgenoom haelgeweervolgordebepaling is twee volgordebepalingbenaderings.
- Albei ondergaan Sanger-volgordebepaling of outomatiese Sanger-volgordebepalingsmetodes.
- Hulle is betrokke by die volgordebepaling van DNA- en RNA-fragmente.
- Boonop is albei metodes belangrik in molekulêre diagnostiek en navorsingsdoeleindes.
- Op die oomblik is albei tegnieke outomaties of rekenaargebaseerd.
- Albei tegnieke maak staat op die fragmentasie van die genoom.
Wat is die verskil tussen hiërargiese en heelgenoom-haelgeweervolgorde?
Hierargiese haelgeweervolgorde genereer groter grootte fragmente in vergelyking met heelgenoom haelgeweervolgorde, wat werk met klein fragmente van reekse. Dit is dus die sleutelverskil tussen hiërargiese en heelgenoom-haelgeweervolgordebepaling. Boonop bestaan die hiërargiese haelgeweervolgorde uit twee hoofstappe, terwyl die heelgenoom haelgeweervolgorde op een groot stap staatmaak.
Verder is nog 'n verskil tussen hiërargiese en heelgenoom-haelgeweervolgordebepaling dat die resolusie hoër is in heelgenoom-haelgeweervolgordebepaling in vergelyking met hiërargiese haelgeweervolgordebepaling.
Die onderstaande infografika som die verskil tussen hiërargiese en heelgenoom haelgeweervolgorde op.
Opsomming – Hiërargiese vs Heelgenoom Haelgeweervolgorde
Hierargiese en heelgenoom-haelgeweervolgordebepaling is twee tegnieke om groot genome te volgorde. Die hiërargiese haelgeweervolgorde is 'n twee-stap proses van volgordebepaling waar die genoom in groter fragmente opgebreek word. Daarteenoor is die heelgenoom-haelgeweer-volgordebepaling 'n enkelstap-volgordebepaling waar die genoom in klein fragmente opgebreek en direk in volgorde bepaal word. Dit is dus die sleutelverskil tussen hiërargiese en heelgenoom-haelgeweervolgordebepaling. Boonop kan die tegniese aspekte tussen die twee tegnieke verskil.
