Sleutelverskil – Herstel van basisuitsnyding vs nukleotieduitsnydingherstel
DNS word gereeld aan skade blootgestel as gevolg van verskeie interne en eksterne faktore. Sellulêre herstelstelsels korrigeer egter die skade onmiddellik en voortdurend voordat dit mutasies word of voordat dit na opvolgende generasies oorgedra word. Daar is drie tipes eksisie-herstelstelsels in die selle: nukleotied-eksisie-herstel (NER), basis-eksisie-herstel (BER) en DNA-mispassing-herstel (MMR) om enkelstring-DNA-skade te herstel. Die sleutelverskil tussen basis-eksisie-herstel en nukleotied-uitsny-herstel is dat basis-eksisie-herstel 'n eenvoudige herstelstelsel is wat in die selle werk om enkelnukleotiedskade wat endogeen veroorsaak word te herstel, terwyl nukleotied-uitsnyherstel 'n komplekse herstelstelsel is wat in die selle werk om vergelykend te herstel. groter, beskadigde streke wat eksogeen veroorsaak word.
Wat is Base Excision Repair?
Basis-uitsnyherstel is die eenvoudigste weergawe van DNA-herstelstelsel wat die selle het. Dit word gebruik om geringe skade in DNA te herstel. DNS-basisse word gemodifiseer as gevolg van deaminering of alkilering. Wanneer daar basisbeskadigings is, herken en aktiveer DNA-glikosilase die basiseksisieherstelstelsel en herstel dit met behulp van ensieme AP-endonuklease, DNA-polimerase en DNA-ligase. Die volgende stappe is by die BER-stelsel betrokke.
- Herkenning en verwydering van 'n verkeerde of beskadigde basis deur 'n DNA-glikosilase om 'n abasiese plek te skep (plekke van basisverlies – apiuriene of apirimidiniese plekke).
- Abasiese insnyding deur 'n apuriene/apirimidiniese endonuklease
- Verwydering van die oorblywende suikerfragment deur 'n liase of fosfodiesterase
- Gapopvulling deur 'n DNA-polimerase
- Seël van die nick deur 'n DNA-ligase
Figuur 01: Basis-eksisie-herstelpad
Wat is Nukleotied-uitsnyherstel?
Nukleotied-uitsnyherstel (NER) is 'n belangrike DNA-uitsny-herstelstelsel in selle. Dit is in staat om beskadigde streke tot 30 basisse lank te herstel en te vervang en dit word gerig deur die onbeskadigde sjabloonstring. Algemene DNS-skade vind plaas as gevolg van ultravioletstraling en NER beskerm DNS deur daardie skade te herstel onmiddellik voordat dit mutasies word en na toekomstige geslagte oorgaan of siektes veroorsaak. NER bied spesifiek beskerming teen mutasies wat indirek deur eksogene faktore soos omgewings- en chemiese karsinogene veroorsaak word. NER word in byna alle organismes gesien, en dit herken skade wat aansienlike vervorming in die DNA-heliks veroorsaak.
Die NER-proses behels die werking van baie proteïene soos XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF, XPG, CSA, CSB, ens. en verloop via verskeie sny- en plak-agtige meganismes. Daardie proteïene is noodsaaklik vir die voltooiing van die herstelproses, en 'n defek in een van die NER-proteïene is noodsaaklik en kan seldsame resessiewe sindrome veroorsaak: xeroderma pigmentosum (XP), Cockayne-sindroom (CS) en die fotosensitiewe vorm van die broshaarversteuring trichothiodystrophy (TTD).
Figuur 02: Nukleotied-uitsnydingherstel
Wat is die verskil tussen Base Excision Repair en Nucleotide Excision Repair?
Basis-uitsnyherstel vs nukleotied-uitsnyherstel |
|
| Basis-eksisieherstel (BER) is 'n DNA-herstelstelsel wat in selle voorkom. | Nukleotied-eksisieherstel (NER) is nog 'n tipe DNA-herstelstelsel wat in selle gevind word. |
| Herkenning van DNA-addukte | |
| BER herstel skade aan klein DNA-addukte. | NER herstel groot DNA-addukte. |
| DNA-skade | |
| BER erken die skade wat nie noemenswaardige vervormings aan die DNA-heliks veroorsaak nie. | NER erken die skade wat aansienlike vervormings aan die DNA-heliks veroorsaak. |
| Oorsake van DNA-skade | |
| BER herstel die skade wat deur endogene mutagene veroorsaak is. | NER herstel die skade wat deur eksogene mutagene veroorsaak is. |
| Kompleksiteit | |
| BER is die minste komplekse herstelstelsel | Dit is meer kompleks as BER. |
| Need for Proteins | |
| BER vereis nie ander proteïene nie. | NER vereis verskeie geenprodukte, veral proteïene, om beskadigde en onbeskadigde streke te onderskei. |
| Geskiktheid | |
| BER is geskik vir die regstelling van enkelbasisskade. | NER is geskik om die beskadigde streke te vervang. |
Opsomming – Herstel basis-uitsnyding vs nukleotied-uitsnydingherstel
NER en BER is twee tipes DNA-uitsnyherstelprosesse wat in selle gevind word. BER is in staat om klein skade wat endogeen veroorsaak word, te herstel terwyl NER skadestreke tot 30 basispaarlengte kan herstel wat meestal deur eksogene veroorsaak word. BER verskil van NER in die tipes substrate wat herken word en in die aanvanklike splitsingsgebeurtenis. BER kan ook skade herken wat nie deur beduidende vervormings in die DNA-heliks veroorsaak is nie, terwyl NER beduidende vervormings van die DNA-heliks herken. Dit is die verskil tussen herstel van basisuitsnyding en nukleotieduitsnyding.
