Sleutelverskil – genotipering vs volgordebepaling
Genotipering en volgordebepaling is twee tegnieke wat uitgevoer word om inligting oor die nukleïensure, hoofsaaklik DNA van 'n organisme, te verkry. Die sleutelverskil tussen genotipering en volgordebepaling is dat genotipering die proses is om te bepaal watter genetiese variant die individu besit deur merkers te gebruik, terwyl volgordebepaling die bepaling van die korrekte volgorde van die nukleotiedvolgorde binne die gegewe fragment van DNA is.
Wat is genotipering?
Genotipering is die bepaling van die genetiese samestelling van 'n individu deur gebruik te maak van 'n volgorde van DNS en merkers en vergelyking en identifikasie van die oorerwing daarvan. Genotipering is belangrik in evolusionêre biologie, bevolkingsbiologie, taksonomie, ekologie en genetika van die organismes. Dit kan deur verskillende tegnieke uitgevoer word, insluitend DNS-volgordebepaling, polimerase-kettingreaksie, beperkingsfragmentlengte-polimorfisme (RFLP), ewekansige versterkte polimorfiese opsporing, geamplifiseerde fragmentlengte-polimorfisme (AFLP), DNA-mikroskikkings, ens.
Genotipering behels opeenvolging van spesifieke klein fragmente van DNA-volgordes en vind van verwantskap van die genetiese samestelling met ander individue wat genetiese merkers gebruik. Dit bepaal die enkelnukleotied polimorfismes (SNPs) onder die individue of die spesifieke allele. Genotipering is van toepassing op 'n wye reeks organismes insluitend mense. Dit is ook van toepassing op mikroörganismes soos virusse, swamme ens. en kan gebruik word om hul genetiese variante met die verwysingsprofiele te bepaal. In molekulêre epidemiologie en forensiese mikrobiologie word die beheer van patogene, veral mikroörganismes, gedoen deur die inligting verkry uit genotipering. Genotipering is baie belangrik in stamboomontleding. Mense word genotipeer om moederskap en vaderskap te bevestig. Genotipe sal die dominante en resessiewe allele van gene openbaar wat spesifieke eienskappe bepaal.
Figuur_1: RFLP genotipering
Wat is volgordebepaling?
Opeenvolging is die proses om die korrekte volgorde van die nukleotied in 'n gegewe fragment van DNA of RNA te bepaal. Feitlik alle inligting wat benodig word vir die groei en ontwikkeling van 'n organisme word in sy genoom gekodeer. Die beskikbaarheid van tegnieke om 'n paar honderd nukleotiede lang nukleïensure fragmente te produseer en te skei het gelei tot die ontwikkeling van prosedures om die presiese nukleotiedvolgorde van 'n gegewe fragment van DNA of RNA te bepaal. Verskillende tipes volgordebepalingmetodes is vandag beskikbaar. Hierdie volgordebepalingsmetodes, tesame met die tegnologieë vir die konstruksie van genoombiblioteke wat die hele genoom van 'n organisme verteenwoordig, fasiliteer die volgordebepaling van die hele genoom van daardie organisme, en maak 'n diepgaande ontleding van geenstrukture, geenfunksies, geenliggings, geenuitdrukkings, geenkartering, geenregulerende streke ens.
Die totale genome van baie virusse, verskeie bakterieë, argebakterieë, gis en verskeie ander organismes is in volgorde en gekarteer. Menslike genoomprojek het dit moontlik gemaak om die hele menslike genoom te volgorde en te karteer en sy eerste konsep in 2003 te publiseer. Dit is 'n groot mylpaal in die vooruitgang van biologie. Menslike genoomvolgordes word nou in die mediese sektor gebruik om genetiese oorsake vir seldsame siektes te identifiseer, siekterisiko by pasgeborenes te skerm, genetiese besonderhede van verskillende kankers te identifiseer, nuwe terapeutika te ontwikkel, en nuwe diagnostiese hulpmiddels te ontwikkel, ens.
In die plantwêreld is rysgenoom en Arabidopsis-genome georden. Kennis van hierdie rye sal ongetwyfeld 'n rewolusie in ons begrip van hoe selle en organismes funksioneer.
Figuur_2: 'n Outoradiograaf van sanger-volgorde
Wat is die verskil tussen genotipering en volgordebepaling?
Genotipering teen volgordebepaling |
|
| Genotipering is die proses om die genetiese samestelling van 'n individu te bepaal en die groep of die taksonomie van daardie organisme na te gaan. | Opeenvolging is die proses om die presiese volgorde van nukleotiede van 'n gegewe DNA of RNA-fragment te bepaal. |
| tegnieke | |
| RFLP, geenvolgordebepaling, PCR, DNA-mikroskikkings, AFLP ens. | Sanger-volgorde, Gilbert-volgorde, Pyrosequencing, Next Generation Sequencing, Haelgeweer-volgorde, ens. |
| Groot bekommernisse | |
| Dit is meer bekommerd oor die vraag of die genotipe verskille die werklike fenotipe verskille gee. | Dit is meer bekommerd oor die volgorde van die nukleotiede en die verskille en veranderinge daarvan met ander organismes. |
Opsomming – genotipering vs volgordebepaling
Genotipering en volgordebepaling is nuttig om die genetiese inligting van organismes te bestudeer. Genotipering is die proses om genotipe variasies tussen individue te bepaal en hul kategorieë te vind. Volgordebepaling is die proses om die korrekte volgorde van die nukleotiede in die belangstellende fragment of die DNS-gebied te bepaal. Albei tegnieke verskaf belangrike inligting oor die gene en genome.
