Die sleutelverskil tussen MLVA en MLST is dat MLVA die polimorfisme van tandem herhaalde DNS-volgordes gebruik om mikrobiese spesies te karakteriseer, terwyl MLST die polimorfisme van DNS-volgordes van interne fragmente van veelvuldige huishoudingsgene gebruik om mikrobiese spesies te karakteriseer.
Mikrobiese tik word gewoonlik gebruik om die bron en roetes van infeksies te bepaal. Dit bevestig of sluit uitbrake uit. Mikrobiese tipering spoor ook kruisoordrag van gesondheidsorgverwante patogene na en herken virulente stamme. Daarbenewens evalueer mikrobiese tipering die doeltreffendheid van beheermaatreëls van patogeniese mikrobiese spesies. MLVA en MLST is twee molekulêre biologiese tegnieke wat in mikrobiese tik gebruik word.
Wat is MLVA?
Multiple loci VNTR-analise (MLVA) is 'n molekulêre biologiese metode wat die polimorfisme van tandem herhaalde DNA-volgordes gebruik om mikrobiese spesies te karakteriseer. Dit is 'n metode wat gebruik word vir die genetiese ontleding van spesifieke mikrobiese spesies.
Gedurende die eerste stap van MLVA, word elke geteikende VNTR-lokus geamplifiseer deur PCR met flankerende streekspesifieke primers. Dan word die fragmente wat verkry is, geskei deur middel van elektroforese op 'n kapillêre opeenvolger. Die genotipering van elke lokus en resultate wat uit elke monster saamgestel is, maak dit moontlik om 'n mikro-organisme waarvan die spesie bekend is, te karakteriseer. Dit laat ook toe om die subspesie te identifiseer deur alleeltipering en vergelyking met die MLVA-databasisse.
Figuur 01: MLVA
Hierdie MLVA-metode is meer selektief as die MLST-metode. Verder vereis die MLVA-metode nie 'n DNA-volgordebepalingstap nie. Dit maak dit dus moontlik om nabye subspesies of klonale spesies te onderskei.
Wat is MLST?
Multilocus-volgordetipering (MLST) is 'n tegniek wat die polimorfisme van DNS-volgordes van interne fragmente van veelvuldige huishoudingsgene gebruik om mikrobiese spesies te karakteriseer. MLST is 'n tegniek in genetiese analise vir die tik van veelvuldige lokusse.
Figuur 02: MLST
Dit is 'n tipe volgordetipering wat gebruik word as 'n verwysingstegniek om verskillende stamme van mikrobiese spesies te onderskei. Hierdie metode is gebaseer op huishoudelike gene volgordebepaling. Die huishoudelike gene kodeer gewoonlik vir noodsaaklike proteïene van mikrobiese middels soos 'n bakterie. Hierdie reekse van huishoudelike gene het die besonderheid om 'n stabiele polimorfisme met verloop van tyd aan te bied. Daarom is die verskille in volgordes van huishoudelike gene voldoende genoeg om stamme van mekaar te onderskei. Verder was die eerste MLST-skema wat ontwikkel is, Neisseria meningitidis, die veroorsakende middel van meningokokkale meningitis en septisemie. Sedert die bekendstelling daarvan is MLST nie net vir menslike patogene gebruik nie, maar ook vir plantpatogene.
Wat is die ooreenkomste tussen MLVA en MLST?
- MLVA en MLST is twee molekulêre biologiese tegnieke wat in mikrobiese tik gebruik word.
- Albei tegnieke kan vir mikrobiese filogenetiese analise gebruik word.
- Albei tegnieke is gebaseer op genetiese polimorfisme.
- Hulle kan gebruik word vir die opsporing van menslike siektes wat mikrobiese patogene veroorsaak.
- Albei tegnieke moet deur bekwame molekulêre bioloë uitgevoer word.
Wat is die verskil tussen MLVA en MLST?
MLVA is 'n tegniek wat die polimorfisme van tandem herhaalde DNA-volgordes gebruik om mikrobiese spesies te karakteriseer. Intussen is MLST 'n tegniek wat die polimorfisme van DNA-volgordes van interne fragmente van verskeie huishoudingsgene gebruik om mikrobiese spesies te karakteriseer. Dit is dus die belangrikste verskil tussen MLVA en MLST. Verder is die MLVA-metode meer selektief as die MLST-metode.
Die onderstaande infografika bied die verskille tussen MLVA en MLST aan in tabelvorm vir sy-aan-sy vergelyking.
Opsomming – MLVA vs MLST
MLVA en MLST is twee molekulêre biologiese tegnieke wat in mikrobiese tik gebruik word. MLVA gebruik die polimorfisme van tandem herhaalde DNS-volgordes om mikrobiese spesies te karakteriseer, terwyl MLST die polimorfisme van DNS-volgordes van interne fragmente van veelvuldige huishoudelike gene gebruik om mikrobiese spesies te karakteriseer. So, dit is die belangrikste verskil tussen MLVA en MLST.
