Die sleutelverskil tussen heliks-lus-heliks en helix-draai-heliks is dat helix-lus-heliks proteïendimerisasie bemiddel terwyl helix-draai-heliks geenuitdrukking reguleer deur DNA-binding.
'n Proteïenmotief is 'n kort-gekonserveerde volgorde wat met verskillende funksies van DNS geassosieer word. Dit word hoofsaaklik geassosieer met 'n spesiale strukturele terrein met 'n unieke chemiese of biologiese funksie. Hierdie motiewe bevat klein streke van driedimensionele strukture van aminosure met verskillende proteïenmolekules. Gewoonlik bevat individuele motiewe slegs 'n paar elemente. Heliks-lus-heliks en helix-draai-heliks bevat drie elemente. Hul proteïen-strukturele motiewe sluit lusse met verskillende lengtes en ongespesifiseerde strukture in.
Wat is Helix-Loop-Helix?
'n Helix-lus-heliks (HLH) is 'n proteïen strukturele motief wat een van die grootste families van dimeriserende transkripsiefaktore definieer. Hierdie transkripsiefaktore bevat oorblyfsels van aminosure om die DNA-bindingsmeganisme te fasiliteer, en hulle is dimeer. Die proteïen strukturele motief bevat twee α-helikse, en hulle is verbind deur 'n lus. Een heliks lyk kleiner van die twee heliks, en die buigsaamheid van die lus laat dimerisering toe deur te pak en teen 'n ander heliks te vou. Die heliks wat groter lyk, bevat gewoonlik DNA-bindende streke. HLH-proteïene bind aan 'n konsensusvolgorde wat bekend staan as E-box. 'n Konsensusvolgorde is 'n berekende volgorde wat nukleotied- of aminosuurreste bevat. E-boks is 'n element wat reageer op DNA in sommige eukariote wat as 'n proteïenbindingsplek optree en geenuitdrukking reguleer.
Figuur 01: Heliks-lus-heliks-motief
Die HLH-transkripsiefaktore is noodsaaklik vir ontwikkeling en selaktiwiteit. HLH-proteïene behoort hoofsaaklik aan ses groepe, wat van letters A tot F aangedui word. Die transkripsiefaktore wat by elke groep ingesluit is, is:
Groep A: MyoD, Myf5, Beta2/NeuroD1, Scl, p-CaMK, NeuroD en Neurogenins, groep B: MAX, C-Myc, N-Myc en TCF4
Groep C: AhR, BMAL-1-CLOCK, HIF, NPAS1, NPAS3, en MOP5
Groep D; EMC
Groep E: HEY1 en HEY2
Groep F: EBF1
Aangesien die meeste transkripsiefaktore van HLH heterodimeer is, reguleer dimerisasie hulle dikwels.
Wat is Helix-Turn-Helix?
Helix-turn-heliks (HTH) is 'n proteïen strukturele motief wat in staat is om DNA te bind. Elke monomeer is georganiseer met twee α-helikse en word verbind deur 'n kort aminosuurstring. Dit bind aan 'n groef in die DNA-heliks. HTH-motiewe reguleer gewoonlik geenuitdrukking. Die HTH-herkenning en binding aan DNA word deur twee α-helikse uitgevoer. Een heliks beslaan die N-terminale punt terwyl die ander by die C-terminus is. In die meeste scenario's voer die heliks die herkenning van DNA uit. Daarom staan dit bekend as die herkenningshelix. Die binding aan die groef in DNS vind plaas deur 'n reeks Van der Waals-interaksies en waterstofbindings met basisse wat blootgestel is. Die ander α-heliks stabiliseer die proteïen- en DNA-interaksie en speel nie 'n groot rol in herkenning nie. Die herkenningsheliks en die oorblywende heliks het egter 'n soortgelyke oriëntasie.
Figuur 02: Heliks-draai-heliks van TetR-familie
Die HTH word geklassifiseer volgens die struktuur en ruimtelike rangskikkings van die helikse. Die hooftipes is di-heliks, tri-heliks, tetra-heliks en gevleuelde HTH. Di-helikale tipe is die eenvoudigste tipe met twee helikse en 'n onafhanklike vouproteïendomein. Drie-helikale tipe word gevind in die transkripsionele aktiveerder Myb. Tetra-helikale tipe het 'n ekstra C-terminale heliks. Laastens word die gevleuelde HTH gevorm deur 3- heliese bundel en 3- of 4-string beta-vel.
Wat is die ooreenkomste tussen Helix-Loop-Helix en Helix-Turn-Helix?
- Helix-lus-heliks en helix-draai-heliks is proteïen strukturele motiewe.
- Albei bevat 'n gemene deler in basale en spesifieke transkripsiefaktore.
- Hulle kom in eukariote voor.
Wat is die verskil tussen Helix-Loop-Helix en Helix-Turn-Helix?
Helix-lus-heliks bemiddel proteïendimerisasie, terwyl helix-draai-heliks geenuitdrukking reguleer deur DNA-binding. Dit is dus die sleutelverskil tussen helix-lus-heliks en helix-draai-heliks. Boonop bevat HLH sekere proto-onkogene en gene wat betrokke is by differensiasie wat transkripsiefaktore kodeer, terwyl HTH baie homeotiese gene bevat wat vir transkripsiefaktore kodeer. Boonop bestaan heliks-lus-heliks hoofsaaklik uit alfa-heliks wat deur 'n lus verbind word, terwyl heliks-draai-heliks hoofsaaklik bestaan uit lusse wat verbind word deur 'n kort aminosuurstaander wat 'n groef vorm.
Die onderstaande infografika bied die verskille tussen helix-lus-heliks en helix-draai-heliks in tabelvorm aan vir vergelyking langs mekaar.
Opsomming – Helix-Loop-Helix vs Helix-Turn-Helix
'n Proteïenmotief is 'n kort-gekonserveerde volgorde wat met verskillende funksies van DNS geassosieer word. Heliks-lus-heliks en helix-draai-heliks is twee tipes proteïen-strukturele motiewe. Die sleutelverskil tussen helix-lus-heliks en helix-turn-heliks is dat helix-lus-heliks proteïendimerisasie bemiddel, terwyl heliks-draai-heliks geenuitdrukking reguleer deur DNA-binding. HLH is 'n proteïen strukturele motief wat een van die grootste families van dimeriserende transkripsiefaktore definieer. Die proteïen strukturele motief bevat twee α-helikse, en hulle is verbind deur 'n lus. HTH is 'n proteïen strukturele motief wat in staat is om DNA te bind. Elke monomeer is georganiseer met twee α-helikse, en word verbind deur 'n kort aminosuurstring en bind aan 'n groef in die DNA-heliks. So, dit som die verskil tussen helix-lus-heliks en helix-draai-heliks op.
