Die sleutelverskil tussen SF1 en SF2 is hul vermoë om nukleïensure af te wikkel. Terwyl SF1 net DNA afwikkel, wikkel SF2 beide DNA en RNA af.
Helicase is een van die sleutelensieme wat deelneem aan die DNA-replikasieproses sowel as in DNA-herstelprosesse. Die primêre rol van helikase is om deel te neem aan die afwikkelingsproses om die skeiding van dubbelstring-DNS-molekules te fasiliteer. Die ensiem se aktiwiteit is noodsaaklik tydens die aanvangsfase van DNA-replikasie. Helikases word verdeel as Super Family 1 en Super Family 2 hoofsaaklik op grond van hul strukturele verskille. Binne elke Superfamilie is daar meer uiteenlopende tipes helikases.
Wat is SF1?
Super Family 1-helikase is 'n tipe helikase wat 'n heksameriese struktuur langs die interne kernproteïen bevat, wat helikase-aktiwiteit uitbeeld. SF1-helikase is een van die grootste klasse helikase en kan verder gekategoriseer word as SF1A-helikase en SF1B-helikase. Proteïene soos PcrA, Rep en UvrD, behoort aan die klas SF1A-helikases. In vergelyking, proteïene soos RecA en Dda behoort aan die klas van SF1B helikases. Die funksies van SF1-helikases verskil baie. Sommige van die noodsaaklike funksies van SF1-helikases sluit in DNS-replikasie, DNS-rekombinasie, Okazaki-fragmentverwerking, telomeervorming en nukleotied-uitsnyding van DNS-skade. In sommige bakteriese spesies neem SF1-tipe helikase ook deel om horisontale geenoordrag via vervoeging te help. Verder, in virusse, help SF1-helikase met virale replikasie.
Figuur 01: Helicase Action
Daar is baie verskillende motiewe wat verband hou met die struktuur van SF1-helikase. Hulle bevat ten minste 7 bewaarde motiewe onder al die verskillende tipes SF1-helikases (Q, I, Ia, II, III, IV, V en VI). Die struktuur van SF1-helikase is 'n kristal, waar die motiewe saamgegroepeer is. Daar is 'n kenmerkende ATP-bindingsak tussen die motiewe en die DNA-bindingsplek. Die nie-gekonserveerde domeine word versprei om die strukturele integriteit van die helikase molekule te handhaaf. Hierdie domeine kan verskil tussen die SF1A-helikases en SF1B-helikases.
Wat is SF2?
Superfamilie 2 helicase is een van die mees diverse groepe helikase superfamilies. Daar is baie soorte SF2-helikases soos RecQ-agtige helikases, RecG – soos helikases, Rad3/XPD en NS3 helikases. Sommige beperkingsensieme, soos tipe I-restriksie-ensieme, val ook onder hierdie kategorie. Die algemene funksie van SF2-helikases is die afwikkeling van dubbelstring-DNS. Sommige tipes SF2-helikase het egter nie die vermoë om heeltemal as helikase-ensieme op te tree nie. SF2-helikases word ook wyd gebruik in RNA-verwerking. Die DEAD-box-familie van SF2-helikase neem deel aan RNA-verwerking, insluitend transkripsie, splitsing, translasieverwerking en RNA-proteïenkomplekssamestelling.
Figuur 02: Helicase
Die struktuur van SF2-helikase bevat ook bewaarde motiewe. Sommige domeine verskil egter effens van dié van SF1-helikase. Hulle bevat ook 'n ATP-bindingsdomein afgesien van die DNA-bindingsdomein.
Wat is die ooreenkomste tussen SF1 en SF2?
- SF1 en SF2 wys helikase-aktiwiteit.
- Boonop neem albei deel aan DNA-replikasie en rekombinasie.
- SF1 en SF2 is saamgestel uit bewaarde motiewe.
- Albei het 'n ATP-bindingsdomein en 'n DNA-bindende domein.
- Hierdie vorms is multi-domein proteïene.
- Boonop, as mutasies in enige van die tipes plaasvind, sal dit skadelike effekte tot gevolg hê.
- Beide SF1 en SF2 is deurslaggewend om die kontinuïteit van die selsiklus te verseker.
- SF1 en SF2 word in prokariote sowel as in eukariote aangetref.
Wat is die verskil tussen SF1 en SF2?
SF1 en SF2 is twee superfamilies van helicase. Hulle toon 'n wye diversiteit. Die sleutelverskil tussen SF1 en SF2 is dat SF1 hoofsaaklik betrokke is by die afwikkeling van DNA, terwyl SF2 ook deelneem aan RNA-verwerking tydens transkripsie en translasie. Wanneer die verskillende motiewe van die proteïen vergelyk word, verskil SF1 en SF2 hoofsaaklik op grond van motief III en motief IV. Selfs al het hulle 'n strukturele ooreenkoms, vorm SF1-helikase toroïdale heksameriese strukture terwyl SF2 nie hierdie strukturele rangskikkings vorm nie.
Nog 'n verskil tussen SF1 en SF2 is dat SF1-helikase meer adeniennukleotiede verkies, terwyl SF2-helikase al vyf nukleotiede verkies om af te wikkel. Wanneer die afwikkelrigting vergelyk word, translokeer SF1-helikase slegs in die 5'- tot 3'-rigting, terwyl SF2-helikases die vermoë het om saam met die nukleïensure in beide rigtings te translokeer.
Die onderstaande infografika bied die verskille tussen SF1 en SF2 in tabelvorm aan vir vergelyking langs mekaar.
Opsomming – SF1 vs SF2
Helikases is 'n baie belangrike en diverse groep ensieme wat aan DNA-replikasie deelneem. Vanweë die hoë diversiteit daarvan word ensieme egter in superfamilies gekategoriseer. SF1 en SF2 is die twee grootste superfamilies van helikase. Terwyl SF1 hoofsaaklik geassosieer word met verwerking wat verband hou met DNA, word SF2 geassosieer met beide DNA en RNA verwerking. Dit is dus die belangrikste verskil tussen SF1 en SF2. Verder verskil SF1 en SF2 ook in hul strukturele rangskikking aangesien SF2 nie heksameriese strukture vorm nie. Mutasies in die SF1- en SF2-helikase sal lei tot die ontwikkeling van kanker na wanregulering van die selsiklus en ander lewensbelangrike meganismes soos DNA-herstel.
