Verskil tussen Klenow en T4 DNA-polimerase

INHOUDSOPGAWE:

Verskil tussen Klenow en T4 DNA-polimerase
Verskil tussen Klenow en T4 DNA-polimerase

Video: Verskil tussen Klenow en T4 DNA-polimerase

Video: Verskil tussen Klenow en T4 DNA-polimerase
Video: DNA Polymerase (DNA Pol) & ligase - comparison & mechanisms 2024, Desember
Anonim

Die sleutelverskil tussen Klenow en T4 DNA-polimerase is dat Klenow-fragment 'n groot fragment van E. coli DNA-polimerase 1 is, terwyl T4 DNA-polimerase DNA-polimerase 1 van bakteriofaag T4 is.

DNA-polimerases is ensieme wat die vorming van DNA kataliseer deur deoksiribonukleotiede by die 3'-OH einde van 'n voorafbestaande primer te voeg. Daar is verskillende tipes DNA-polimerases. Die meeste DNA-polimerases wat in molekulêre biologie gebruik word, is prokariotiese DNA-polimerases. Klenow-fragment en T4 DNA-polimerase is twee tipes DNA-polimerases wat 'n prokariotiese oorsprong het. Klenow-fragment is die groot fragment wat gegenereer word uit die splitsing van E.coli DNA polimerase 1 in twee fragmente deur bakteriële protease subtilisin. T4 DNA-polimerase is die DNA-polimerase 1 van bakteriofaag T4. Beide Klenow en T4 DNA polimerase het 5′→3′ polimerase en 3′→5′ eksonuklease aktiwiteit. Hulle het albei nie 5′→3′ eksonuklease-aktiwiteit, wat hulle meer geskik maak vir baie toepassings in molekulêre biologie.

Wat is Klenow?

Klenow-fragment is 'n DNA-polimerase wat nuttig is in molekulêre biologie. Wanneer E. coli DNA-polimerase 1 proteolitiese vertering deur bakteriële protease, subtilisien, ondergaan, lei dit tot twee fragmente: een is 'n groot fragment, en die ander een is 'n klein fragment. Klenow-fragment is die groot fragment wat 68 kDa groot is. Klenow-fragment het 5'→3'-polimerase- en 3'→5'-eksonuklease (proeflees) aktiwiteite van DNA Pol I. Die 3'→5'-eksonuklease-aktiwiteit van die Klenow-fragment fasiliteer die verwydering van verkeerde basisse wat polimerisasie vorder. Klenow-fragment bevat nie 5′→3′-eksonuklease-aktiwiteit nie, wat getoon word deur vollengte of ongeskonde E.coli DNA-polimerase 1. Dit is voordelig wanneer slegs die polimerisasie-aktiwiteit alleen nodig is. Klenow-fragmente word gebruik om 5'-oorhange te vul, sintese van probes, volgordebepaling van DNA, sintese van dubbelstring DNA, sintese van cDNA tweede string en plekgerigte mutagenese.

Verskil tussen Klenow en T4 DNA Polimerase
Verskil tussen Klenow en T4 DNA Polimerase

Figuur 01: Klenow Fragment

In sekere toepassings word die 3′→5′ eksonuklease-aktiwiteit van die Klenow-fragment ook ongewens. Dit kan verwyder word deur 'n mutasie in te bring aan die geen wat kodeer vir Klenow-fragment. Die resulterende Klenow-fragment staan bekend as ekso-Klenow-fragment. Daarom het ekso-Klenow-fragment slegs die 5′→3′-polimerase-aktiwiteit van E. coli-polimerase 1.

Wat is T4 DNA-polimerase?

T4 DNA-polimerase is 'n DNA-polimerase wat die sintese van DNA kataliseer. Dit is 'n proteïen gekodeer deur Bakteriofaag T4. Struktureel is T4 DNA-polimerase 'n proteïen van 898 aminosuurresidu (molekulêre gewig van 103,6 kDa). Dit vereis 'n sjabloon en 'n onderlaag om die sintese te kataliseer.

Sleutelverskil - Klenow vs T4 DNA-polimerase
Sleutelverskil - Klenow vs T4 DNA-polimerase

Figuur 02: T4 DNA-polimerase

Soortgelyk aan die Klenow-fragment, het T4 DNA-polimerase beide 5′→3′-polimerase- en 3′→5′-eksonuklease-aktiwiteite. Boonop het dit nie 5′→3′ eksonuklease-aktiwiteit ook nie. T4 DNA-polimerase is nuttig in die vul van 5'-uitsteekende punte van DNA-fragmente. Dit word ook dikwels gebruik vir 5'-end- of 3'-end-etikettering van dubbelstring-DNS. T4 DNA polimerase word gereeld gebruik in stomp kloning. Die 3′→5′ eksonuklease (proeflees) aktiwiteit van T4 DNA polimerase is sterker (meer as 200 keer) as die Klenow fragment. Die belangrikste is dat T4 DNA-polimerase 'n hoë prosessiwiteit het (400 nukleotiede per sekonde).

Wat is die ooreenkomste tussen Klenow en T4 DNA-polimerase?

  • Klenow en T4 DNA-polimerase is twee prokariotiese polimerases.
  • Albei polimerases het 5′→3′-polimerase- en 3′→5′-eksonuklease-aktiwiteit.
  • Hulle vertoon nie 5′→3′-eksonuklease-aktiwiteit nie.
  • Albei ensieme benodig 'n sjabloon en 'n onderlaag om die sintese van DNA te kataliseer.
  • Hierdie ensieme kan hitte-geïnaktiveer word teen 75 0

Wat is die verskil tussen Klenow en T4 DNA-polimerase?

Die sleutelverskil tussen Klenow en T4 DNA-polimerase is die oorsprong van elke ensiem. Klenow-fragment is afkomstig van 'n bakterie terwyl T4 DNA-polimerase afkomstig is van 'n bakteriofaag wat 'n virus is. T4 DNA-polimerase het 'n hoë prosessiwiteit as Klenow-fragment. Boonop het T4 DNA-polimerase 'n sterk proefleesaktiwiteit as die Klenow-fragment. Dit is dus nog 'n verskil tussen Klenow en T4 DNA-polimerase.

Die onderstaande inligtingsgrafika lys meer verskille tussen Klenow en T4 DNA-polimerase in tabelvorm.

Verskil tussen Klenow en T4 DNA-polimerase in tabelvorm
Verskil tussen Klenow en T4 DNA-polimerase in tabelvorm

Opsomming – Klenow vs T4 DNA-polimerase

Klenow-fragment is 'n groot fragment van E. coli DNA-polimerase 1. Dit het slegs 5′→3′-polimerase- en 3′→5′-eksonuklease-aktiwiteite. Dit het nie 5′→3′ eksonuklease aktiwiteit van ongeskonde E. coli DNA pol 1. Daarom is Klenow fragment 'n bakteriële polimerase. Aan die ander kant is T4 DNA-polimerase 'n polimerase wat deur die bakteriofaag T4 gekodeer word. Soortgelyk aan die Klenow-fragment, bevat dit beide 5'→3'-polimerase- en 3'→5'-eksonuklease-aktiwiteite, en dit het nie 5'→3'-eksonuklease-aktiwiteit nie. T4 DNA-polimerase het egter hoë prosessiwiteit en hoë proefleesaktiwiteit as die Klenow-fragment. So, dit is die sleutelverskil tussen Klenow en T4 DNA-polimerase.

Aanbeveel: