Die sleutelverskil tussen konsensus-PKR en pan-PKR is dat konsensus-PKR altyd bewaarde streke teiken, terwyl Pan-PKR veranderlike streke teiken om verskillende stamme van 'n groep te identifiseer
Polymerase-kettingreaksie (PCR) is 'n geenamplifikasietegniek wat uit drie hoofstappe bestaan, naamlik denaturering, uitgloeiing en verlenging. Dit word wyd gebruik in diagnostiek en molekulêre identifikasie. Konsensus PCR en Pan PCR tegnieke is gebaseer op die primer teikens wat elke PCR tipe gebruik.
Wat is Consensus PCR?
Konsensus-PKR is 'n PKR-tegniek wat 'n bewaarde streek vir 'n spesifieke spesie of genera teiken. Daarom word hoogs bewaarde streke vir amplifikasie gekies. Deur hierdie metode kan organismes op grond van hul konsensus geïdentifiseer en onderskei word. Hierdie metode identifiseer 'n bewaarde gebied vir 'n spesifieke spesie. Byvoorbeeld, die 16s rRNA-gebied van bakterieë bly 'n bewaarde gebied onder bakterieë. Daarom word slegs een primerstel benodig vir amplifikasie. In die meeste gevalle kan 'n universele onderlaag spesifiek vir die bewaarde streek gebruik word.
Figuur 01: PCR-tegniek
Deur 'n konsensus-PKR-metode te volg, kan spesiekarakterisering en evolusionêre verwantskappe afgelei word. Gebaseer op die amplifikasie-doeltreffendheid van die betrokke monster-organisme, kan die konsensus van die organisme teenoor die groep ook afgelei word. Verder is die uitvoer van 'n konsensus-PKR noodsaaklik in filogenetiese studies. Dit laat die identifikasie van 'n spesie toe en interpreteer die afwyking wat die spesifieke organisme vertoon in terme van die gemeenskaplike voorouer.
Wat is Pan PCR?
'n Pan PCR is 'n multipleksing-modus van PCR. In hierdie tegniek word verskillende stamme geamplifiseer met behulp van verskeie primer-teikens. Die teikens kan egter algemene teikens vir die stamgroepe wees. Dus, in Pan PCR, kan meer as twee primer stelle op 'n enkele keer gebruik word. Dit kan plaasvind in 'n enkele buis reaksie metode of as 'n multi-buis reaksie metode. Pan PCR is meer tydrowend en meer kompleks in vergelyking met 'n konsensus PCR. As gevolg van hierdie rede kan die interpretasie van die PCR-resultate ook meer kompleks wees in Pan PCR.
Die hooftoepassing van Pan PCR is in molekulêre diagnostiek. Dit maak dit moontlik om te onderskei tussen verskillende stamme van 'n spesie deur teikenversterking. Pan PCR is 'n ideale tegniek om verskillende stamme van 'n enkele spesie te identifiseer wat 'n siekte veroorsaak. In die meeste gevalle is die outomatisering van Pan PCR-tegnieke vir verskeie gesondheidstoestande baie belangrik en is dit 'n betroubare en hoogs doeltreffende tegniek.
Wat is die ooreenkomste tussen Consensus PCR en Pan PCR?
- Konsensus PCR en Pan PCR is twee tipes PCR-tegnieke.
- Albei prosedures volg die algemene drie-stap prosedure – denaturering, uitgloeiing en verlenging.
- Hulle gebruik primers wat teikenspesifiek is.
- Albei reaksies vind plaas in 'n termiese fietsryer.
- Hierdie reaksies kan geoutomatiseer word.
- Albei kan in molekulêre diagnostiek en identifikasie gebruik word; die akkuraatheid verskil egter.
- Hierdie prosedures vereis bekragtiging.
Wat is die verskil tussen Consensus PCR en Pan PCR?
Beide Consensus en Pan PCR volg dieselfde roetine-prosedure. Die belangrikste verskil tussen konsensus PCR en Pan PCR is egter gebaseer op die primer teikens wat elke prosedure gebruik. Terwyl konsensus-PKR altyd bewaarde streke teiken, teiken 'n Pan-PKR veranderlike streke om verskillende stamme van 'n groep te identifiseer. As gevolg van hierdie verskil verskil die onderlaagontwerpprotokolle, die aantal onderlaagstelle wat gebruik word en die spesifieke toepassings.
Die onderstaande infografika som die verskil tussen Consensus PCR en Pan PCR op.
Opsomming – Konsensus PCR vs Pan PCR
PCR, bekendgestel deur Mulli, speel 'n belangrike revolusionêre rol in molekulêre biologie toepassings. Konsensus en Pan PCR is twee tipes PCR gebaseer op hul primer teikengebiede. Terwyl konsensus-PKR bewaarde streke teiken, teiken Pan PCR veranderlike streke en speel 'n belangrike rol in stam-identifikasie. As gevolg van hierdie basiese verskil tussen konsensus PCR en Pan PCR, verskil die spesifieke funksies van elke tipe PCR ook van filogenetiese analise tot molekulêre karakterisering tot molekulêre diagnostiek.
