Sleutelverskil – Exome vs Transcriptome
'n Geen bevat koderende en nie-koderende streke daarin. Koderreekse staan bekend as eksons, en nie-koderende rye staan bekend as introne. Die nukleotiedvolgorde van die eksons van 'n geen verteenwoordig die genetiese kode van die geen om die spesifieke proteïen te sintetiseer. Eksons bly dus in die mRNA-molekule. Die totale eksongebied van die genoom staan bekend as eksoom, en dit is 'n belangrike deel van die genoom. Die genetiese kode van die gene word omgeskakel na die genetiese kode van die mRNA-molekule, wat nodig is vir die produksie van proteïen. Die hele mRNA-molekules wat op 'n slag in 'n sel of 'n selpopulasie getranskribeer word, staan as 'n transkripsie bekend. Die sleutelverskil tussen eksoom en transkriptoom is dat eksoom die volgordes van die eksonstreke van die genoom verteenwoordig, terwyl transkriptoom die totale mRNA van 'n sel of 'n weefsel op 'n gegewe tydstip verteenwoordig.
Wat is Exome?
Gene is saamgestel uit eksone, introne en regulatoriese rye. Eksons is die geenstreke wat tydens die transkripsie in mRNA-volgorde getranskribeer word. Introne en ander nie-koderende streke word tydens die transkripsie verwyder. Die nukleotiedvolgorde van eksons bepaal die genetiese kode van die geen wat die spesifieke proteïen sintetiseer wat dit kodeer. Slegs eksons bly binne mRNA van 'n proteïen oor. Die versameling van eksone in die genoom staan bekend as eksoom van 'n organisme. Dit verteenwoordig 'n deel van die genoom wat in gene uitgedruk word. By mense is eksoom 1% van die genoom verantwoordelik. Dit is die proteïenkoderende gedeelte van die menslike genoom.
Figuur 01: Exome
Wat is Transcriptome?
Die transkripsie is die versameling van alle proteïenkoderende en nie-koderende transkripsies (RNA's) in 'n gegewe weefsel. Transkriptoom verteenwoordig die versameling van totale mRNA-molekules wat deur die gene in 'n sel of 'n weefsel uitgedruk word. Die transkriptoom van 'n sel kan gevarieer word met die transkripsie van 'n ander seltipe. Die transkriptoom is ook dinamies - dit verander met tyd in reaksie op beide interne en eksterne stimuli. Selfs binne dieselfde weefsel of binne dieselfde seltipe, kan transkriptoom na 'n paar minute verander.
Transkriptoom verskil van eksoom van 'n organisme. Transkriptoom sluit slegs die uitgedrukte eksoomreekse in. Alhoewel die eksoom van 'n sel dieselfde bly, verskil transkriptoom tussen selle aangesien geenuitdrukking nie dieselfde is vir alle selle of weefsels nie. Slegs noodsaaklike gene word in verskillende selle en weefsels uitgedruk. Geenuitdrukking is 'n weefsel- of seltipe-spesifieke proses. Dit word gereguleer deur verskeie faktore insluitend omgewingsfaktore. Daarom kan transkriptoom verskil met eksterne omgewingstoestande.
Transcriptome word gebruik as 'n voorloper vir proteomika-studies. Alle proteïene is afgelei van mRNA-volgordes. Translasiewysigings kan die veranderinge in proteïene tot gevolg hê. Transkriptoom verskaf egter belangrike basiese inligting vir die proteomiese studies.
Figuur 02: Transkriptoom van embrioniese stamselle
Wat is die verskil tussen Exome en Transcriptome?
Exome vs Transcriptome |
|
| Exome is die versameling van die proteïenkoderende streek van die gene. | Transcriptome is die versameling van alle getranskribeerde RNA insluitend mRNA. |
| Voorbeeld | |
| Exome word bestudeer met behulp van DNA-monster. | Transkriptoom word bestudeer met behulp van 'n RNA-monster. |
| Studiemetode | |
| Hele eksoomvolgorde is die metode om eksoom te bestudeer. | RNA-volgordebepaling is die metode om transkriptoom te bestudeer. |
Opsomming – Exome vs Transcriptome
Eksons is die koderende volgordes van die gene en bepaal die mRNA-volgordes van die proteïene. Die versameling van hierdie koderende volgordes (eksone) staan bekend as eksoom van 'n organisme. Gene word in mRNA-molekules getranskribeer voordat proteïene gemaak word. Die totale mRNA-molekules van 'n sel of 'n weefsel op enige gegewe tydstip staan bekend as transkriptoom. Transkriptoom verteenwoordig die gene wat op enige gegewe tyd aktief in mRNA uitgedruk word. Transkriptoom is sel- en weefselspesifiek en beïnvloed die omgewingstoestande. Dit is die verskil tussen eksoom en transkripsie.
