Die sleutelverskil tussen crRNA tracrRNA en gRNA is dat crRNA een van die twee tipes RNA van CRISPR is, wat komplementêr is tot die teiken-DNS-volgorde, terwyl tracrRNA die tweede tipe RNA van CRISPR is, wat dien as 'n bindingsteier vir die Cas-nuklease en gRNA is een van die twee hoofkomponente van die CRISPR-Cas9-stelsel van bakterieë en archaea wat teiken-DNS herken en Cas-proteïene lei om dubbelstring-breuke in teiken-DNS te maak.
CRISPR staan vir gegroepeerde gereelde afgewisselde kort palindromiese herhalings. Dit is een van die immuunstelsels in bakterieë en archaea. Bakterieë en archaea gebruik hierdie stelsel om hulself teen virale patogene te beskerm. Dit is een van die wonderlikste meganismes wat 'n suksesvolle genetiese modifikasie behels. Hierdie meganisme (CRISPR-Cas9) word gebruik as 'n nuwe geen-redigeringsinstrument in Biotegnologie. Dit het nuwe vooruitgang tot biotegnologie gebring, veral op die gebied van genetiese ingenieurswese.
Daar is twee hoofkomponente van die CRISPR-Cas9-stelsel. Hulle is gids-RNA (gRNA) en CRISPR-geassosieerde (Cas) nukleases. Gids-RNA is 'n spesifieke RNA-volgorde wat Cas-proteïene lei om teiken-DNS te klief. Gids-RNA bestaan uit twee tipes RNA. Hulle is crispr RNA (crRNA) en tracrRNA. CRISPR-geassosieerde (Cas) nukleases is nie-spesifieke endonukleases wat dubbelstring-breuke in teiken-DNS maak. Deur dubbelstring-breuke in teiken-DNS te maak, rig bakterieë en archaea hul endogene herstelmeganismes om virale DNA te inaktiveer.
Wat is crRNA?
crRNA of Crispr RNA is een van die twee tipes gids-RNA. Struktureel is dit 'n 17-20 nukleotiedvolgorde. Die mees waardevolle kenmerk van crRNA is dat dit aanvullend tot die teiken-DNS is. Daarom pas crRNA by die virale DNA-volgorde. Die spesifisiteit van die CRISPR-Cas 9-stelsel hang af van crRNA. In bakterieë bestaan crRNA saamgesmelt met die tracrRNA-volgorde, wat die tweede tipe CRISPR-RNA is. crRNA-produksie word veroorsaak deur die herblootstelling van bakterieë aan 'n virus. Wanneer dit blootgestel word, vind transkripsie van die geen plaas wat vir crRNA kodeer. Dan begin die verdedigingsmeganisme teen die virus.
Figuur 01: CRISPR-Cas9-stelsel
Wat is tracrRNA?
Transaktiverende crRNA of tracrRNA is die tweede deel van guideRNA of CRISPR RNA. Dit word uitgespreek as naspoor-RNA. tracrRNA dien as die bindingsteier vir die endonuklease Cas 9-proteïen. Met ander woorde, tracrRNA werk as die handvatsel om Cas9 na die teiken-DNS te lei. Struktureel het tracrRNA 42 nukleotiede. Dit bestaan gekombineer met crRNA.
Wat is gRNA?
Gids-RNA of gRNA is een van die twee hoofkomponente van die CRISPR-Cas9-immuunstelsel. Dit is 'n spesifieke RNA-volgorde wat uit twee elemente bestaan: crRNA en tracrRNA. gRNA herken die teiken-DNS en rig Cas-proteïene om dubbelstring-breuke in teiken-DNS te maak. Om dit te kan doen, bestaan crRNA uit 'n komplementêre volgorde van teiken-DNS terwyl tracrRNA Cas-proteïene lei wat as 'n handvatsel werk.
Figuur 02: gRNA
Die ontwerp van die korrekte gRNA is 'n kritieke stap in die CRISPR-Cas9-geenredigeringsinstrument. Daarom hang die sukses en die redigeerdoeltreffendheid van die CRISPR-stelsel af van die korrekte volgorde van gRNA. gRNA kan uitgedruk word in selle vanaf 'n getransfekteerde plasmied. Wanneer gekloonde plasmiede in selle ingebring word, genereer gasheerselle gRNA. Die mees algemeen gegenereerde gRNA bestaan uit 100 basispare.
Wat is die ooreenkomste tussen crRNA tracrRNA en gRNA?
- crRNA, tracrRNA en gRNA is RNA-volgordes wat in bakterieë en archaea gevind word.
- Hulle behoort almal aan die CRISPR-stelsel.
- gRNA word van crRNA en tracrRNA gemaak.
- Hulle is betrokke by die herkenning van die bakteriofaag-DNA en die leiding van endonukleases na teiken-DNS.
- Al drie tipes RNA is dus betrokke by die rig van die Cas9-nuklease om dubbelstring-breuke in indringer vreemde genetiese materiale te maak.
- Die sukses van die CRISPR-eksperiment hang af van al drie tipes RNA.
Wat is die verskil tussen crRNA tracrRNA en gRNA?
crRNA is 'n deel van gRNA van CRISPR wat aanvullend tot die teiken-DNS is, terwyl tracrRNA die tweede deel van gRNA is, wat dien as 'n bindende steier vir die Cas-nuklease.gRNA is die kombinasie van crRNA en tracrRNA, en dit is een van die twee komponente van CRISPR-Cas9-stelsel, wat teiken-DNS herken en nukleases lei om dubbelstring-breuke in teiken-DNS te maak. So, dit is die sleutelverskil tussen crRNA tracrRNA en gRNA.
Die volgende tabel som die verskil tussen crRNA tracrRNA en gRNA op.
Opsomming – crRNA vs tracrRNA vs gRNA
CRISPR-Cas9-stelsel is 'n immuunstelsel van bakterieë en archaea. Hierdie stelsel word gebruik as 'n geen-redigeringsinstrument in Biotegnologie. CRISPR bestaan uit twee tipes RNA, naamlik CRISPR RNA (crRNA) en transaktiverende CRISPR RNA (tracrRNA). Hulle staan gesamentlik bekend as gidsRNA of gRNA. Hierdie RNA herken teikenvolgordes van indringer patogene en lei endonukleases om dubbelstring-breuke in die teiken-DNS te maak. Sodra dubbelstrengbreuke in die vreemde genetiese materiaal gemaak is, inaktiveer endogene herstelmeganisme (nie-homologe eindverbinding; NHEJ) die vreemde DNA deur mutasies in te voer. Dus, dit som die verskil tussen crRNA tracrRNA en gRNA op.
