Die sleutelverskil tussen ooreenkoms en identiteit in volgordebelyning is dat ooreenkoms die ooreenkoms (ooreenkoms) tussen twee rye in vergelyking is, terwyl identiteit die aantal karakters is wat presies ooreenstem tussen twee verskillende rye.
Bioinformatika is 'n interdissiplinêre veld van wetenskap wat hoofsaaklik molekulêre biologie en genetika, rekenaarwetenskap, wiskunde en statistiek behels. Volgordebelyning is 'n belangrike term in bioinformatika. Dit is die prosedure waarin die volgordes van DNA, RNA of proteïen gerangskik word om streke van ooreenkoms te identifiseer wat 'n gevolg is van funksionele, strukturele of evolusionêre verwantskap tussen die rye. Aan die einde van die belyning sal hulle as rye binne 'n matriks aangebied word. Om die identiese karakters in opeenvolgende kleure in lyn te bring, is ingevoegde gapings tussen die oorblyfsels teenwoordig.
Wat is ooreenkoms?
Gelykvormigheid in volgordebelyning is die ooreenkoms tussen twee rye wanneer dit vergelyk word. Hierdie feit is afhanklik van die identiteit van rye. Ooreenstemming toon die mate waarin die residue in lyn is. Gevolglik bevat soortgelyke rye soortgelyke eienskappe. In bioinformatika is ooreenkoms 'n instrument om die ooreenkoms tussen twee proteïene te bepaal.
Figuur 01: Ooreenstemming in volgordebelyning
Daar is twee hoofstappe vir die volgorde van belyningsproses. Die aanvanklike stap is paarsgewyse belyning, wat help om die optimale belyning tussen twee rye (insluitend gapings) te vind deur algoritmes soos BLAST, FastA en LALIGN te gebruik. Die bypassende algoritme vind die minimum aantal wysigingsbewerkings; in-dels en substitusies om een ry by die ander ry te belyn. Na paarsgewyse belyning is dit nodig om twee kwantitatiewe parameters uit elke paarsgewyse vergelyking te verkry. Hulle is identiteit en ooreenkoms.
Wat is identiteit?
Identiteit in volgordebelyning is die aantal karakters wat presies ooreenstem tussen twee verskillende rye. Leemtes tel dus nie by die beoordeling van identiteit nie. Die meting word beskou as in verhouding tot die korter ry tussen die twee rye. Dit impliseer aansienlik dat dit die effek het waar die volgorde-identiteit nie oorganklik is nie. As X=Y en Y=Z, dan is X nie noodwendig gelyk aan Z nie. Dit word afgelei in terme van die identiteitsafstandmaatstaf.
Figuur 02: Identiteit in volgorde-belyning
Byvoorbeeld, X het 'n ry van AAGGCTT, Y het 'n ry van AAGGC en Z het 'n ry van AAGGCAT. Identiteit tussen X en Y is 100% {5 identiese nukleotiede / min[lengte(X), lengte(Y)]}. Identiteit tussen Y en Z is ook 100%. Maar identiteit tussen X en Z is slegs 85% {(6 identiese nukleotiede / 7)}.
Wat is die ooreenkomste tussen ooreenkoms en identiteit in volgorde-belyning?
- Beide ooreenkoms en identiteit is twee terme wat ons in volgordebelyning gebruik.
- Hulle verwys ook na die ooreenkoms tussen die twee rye.
- Bowendien druk ons dit as 'n persentasiewaarde uit.
Wat is die verskil tussen ooreenkoms en identiteit in volgordebelyning?
Gelykvormigheid in belyning vertel die ooreenkoms tussen twee reekse wanneer dit vergelyk word, terwyl identiteit in volgordebelyning die hoeveelheid karakters vertel wat presies ooreenstem tussen twee verskillende reekse. Daarom is dit die sleutelverskil tussen ooreenkoms en identiteit in volgordebelyning.
Opsomming – Ooreenkomstigheid teenoor identiteit in volgordebelyning
Rekwensiebelyning help om streke van ooreenkomste in DNA, RNA of proteïen te identifiseer as gevolg van funksionele, strukturele of evolusionêre verwantskap tussen die rye. Gevolglik is ooreenkoms en identiteit twee sleutelterme in die konteks van volgordebelyning. Die belangrikste verskil tussen hierdie twee terme is dat ooreenkoms die ooreenkoms tussen twee reekse in vergelyking is, terwyl identiteit die aantal karakters is wat presies ooreenstem tussen twee verskillende reekse. Dit is dus die opsomming van die verskil tussen ooreenkoms en identiteit in volgordebelyning.
